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Energie, Ecologie, Environnement
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Ingénierie des systèmes complexes et logiciels
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Innovation Sociale - Sociétale - Solidaire
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Numérique
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Qualité de vie - Santé - Aliments
Noeud national de l'Institut Français de Bioinformatique (IFB)
Unité de recherche UMS 3601
L'IFB-core est le noeud national (hub) de l'Institut Français de Bioinformatique (IFB). Le hub prend en charge les aspects administratifs et techniques pour l'IFB et met en oeuvre la politique scientifique et technologique définie par le Comité de Pilotage de l'IFB.
L'IFB rassemble 36 plateformes de bioinformatique dépendant des cinq principaux organismes publics de recherche, CNRS, INRA, INRIA, CEA, INSERM, des universités, du CIRAD, et des instituts Pasteur et Curie, regroupées en six pôles régionaux couvrant le territoire national.
L'IFB a pour mission de fournir des services de base en bioinformatique aux chercheurs et ingénieurs des sciences du vivant. L'IFB est une infrastructure de services en bioinformatique. Les services offerts peuvent être classés en 5 grandes catégories :
- Données : Mettre à disposition des collections de données à haute valeur ajoutée
- Outils : Fournir des outils et services innovants pour analyser les données
- Appui : Fournir un appui et un hébergement aux projets de recherche de la communauté des sciences du vivant
- Formations : Offrir des formations
- Infrastructure : Donner accès à une infrastructure informatique fournissant aussi bien des moyens matériels (CPU, stockage, réseau, etc.) que l'accès aux collections de données publiques classiques et aux nombreux outils de base du domaine
Thématiques d'innovation
- Energie, Ecologie, Environnement
- Numérique
- Ingénierie des systèmes complexes et logiciels
- Conception logiciel, big-data, cloud, calculs haute performance
- Modélisation et simulation
- Qualité de vie - Santé - Aliments
- Modélisation numérique, visualisation de donnée, Interaction Homme - Machine
- Innovation Sociale - Sociétale - Solidaire
- Technologies thérapeutiques (Médicaments, génétique, biomarqueurs, biomolécules...)
- Santé et alimentation animale
- Sciences, techniques et savoirs
- Qualité et sécurité sanitaire, alimentaire
- Logiciel libre, web
1, avenue de la Terrasse
Bâtiment 21
91198 GIF-SUR-YVETTE
Expertises
- Biologie / Biotechnologies (biologie moléculaire, validation d'hypothèses thérapeutiques, analyse de données)
- génomique, épigénomique, métagénomique, phylogénie, métabolomique
- épidémiologie, biostatistique intégrative
- modélisation 3D des protéines et de leurs interactions, calcul distribué, big-data
Secteurs d'applications
- Informatique
- Biotechnologies
- Santé / Bien-être
- Agroalimentaire
- Agriculture
- Enseignement / Formation
Effectif total
Equipements ouverts à la collaboration
- le cloud IFB : mise à disposition d'une infrastructure des technologies de l'information et de la communication (TIC) spécifiquement dédiée à la gestion et analyse des données produites par les sciences du vivant. Cette infrastructure TIC offre non seulement des moyens matériels (CPU, disques, mémoire, réseau), mais également un accès aux multiples collections de données publiques largement utilisées en biologie http://www.france-bioinformatique.fr/fr/cloud
Mots clés
- ADN
- agro-alimentaire
- algorithmique du texte et des arbres
- analyse fonctionnelle
- animaux
- apprentissage
- ARN
- bactéries
- biologie
- biomédicale
- biostatistique intégrative
- biotechnologie
- cancer
- chromatine
- classification
- cloud
- combinatoire
- datawarehouses
- dynamique moléculaire
- environnement
- gènes
- génotypage
- gestion de données
- imagerie
- informatique
- lipidomique
- maladies cardiovasculaires
- métabolomique
- méthylation
- micro-organismes
- modélisation
- mutations
- neurosciences
- omique
- optimisation
- paludisme
- plantes
- procaryotes
- sécurisation
- séquençage haut débit
- structuration
- structure d'ARN
- VIH
Offre de valorisation
Exemple(s) de travaux
Publications
Relations industrielles et scientifiques
Collaborations scientifiques
- collaborations multiples (+36 plates-formes de bioinformatique en France)
http://www.france-bioinformatique.fr/fr/plateformes
- l'IFB est le n?ud français de l'infrastructure de recherche européenne en bioinformatique : ELIXIR https://www.elixir-europe.org (20 pays membres)
- collaborations avec l'Université d'Amsterdam et l'Université de Berlin
Collaborations privées
- France :
+ start-up dans les domaines pharmaceutique et de l'informatique et logiciels
+ PME dans le domaine des Biologie / Biotechnologies, de l'agronomie, de l'agriculture et de l'informatique et logiciels
+ grandes entreprises dans les domaines pharmaceutique, de l'agroalimentaire, de l'agronomie, de l'exploitation minière et de l'informatique et logiciels
+ entreprises de taille intermédiaires dans les domaines des biotechnologies et de l'agronomie
- Europe : grandes entreprises dans les domaines pharmaceutique et de l'agronomie (Suisse, Royaume-Uni, Allemagne, Espagne)
- International : entreprises dans les domaines pharmaceutique, des biotechnologies et de l'informatique et logiciels (Etats-Unis, Japon)
Etablissements de rattachement
Département(s) de recherche
- STIC (Sciences et technologie de l'information et de la communication)