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Qualité de vie - Santé - Aliments
ICSN / Plateforme de PCR quantitative haut débit (qPCR)
Plateforme technologique
La plateforme de PCR quantitative haut débit "QPCR-ICSN" propose la réalisation d'études de transcriptomes à bas et hauts débits, pour la recherche biologique et médicale. Les principales applications sont de quantifier avec sensibilité et précision le niveau d'expression des gènes, l'analyse de mutations et de variants ou la recherche de marqueurs. Ces applications concernent de nombreux domaines d'investigation : pathologies, cancers et chimiorésistances, détection de virus, de bactéries pathogènes ou d'OGM. Pour répondre aux besoins des laboratoires, la plateforme offre différentes technologies (SyBr Green et TaqMan) et des formats adaptés aux bas (96, 384 réactions/run) et hauts débits (micro et nano-fluidique 12000 réactions/run). La plateforme assure la prise en charge partielle ou complète des projets : conception, design des sondes, préparation des échantillons, contrôles qualité, normalisation et traitement des données. La plateforme est localisée sur le campus CNRS de Gif-sur-Yvette et dispose d'équipement de dernière génération. Elle propose aux académiques et aux industriels des activités de prestations ou de collaborations sur des projets de recherche.
Thématiques d'innovation
Laboratoire de rattachement
1, avenue de la Terrasse
ICSN, CNRS-UPR 2301
91198 GIF-SUR-YVETTE
Spécificités
- Echelle d'étude : molécule- Objet d'étude : microorganismes (virus, bactérie), pan-espèces (plante, animal, homme)
Technologies utilisées
PCR quantitative à haut débitMots clés
Equipements spécifiques
| Nom | Modèle | Marque |
|---|---|---|
| Fluorimètre Qubit | Qubit/ | Thermo Fisher Scientific |
| Broyeur échantillons | Precellys Cryolys/ | Bertin |
| Electrophorèse ARN | Bioanalyzer 2100/ | Agilent |
| Lyophilisateur microplaque | AES 1000/ | Savant |
| PCR gradient | Mastercycler gradient/ | Eppendorf |
| PCR quantitative 384 avec option cartes microfluidiques | ABI 7900 HT avec robot chargement/ | Applied Biosystems |
| PCR quantitative 384 nouvelle génération avec option OpenArray en nanofluidique | QuantStudio 12KFlex avec système Accufill/ | Applied Biosystems |
| PCR quantitative plaques 96 | Mastercycler/ | Eppendorf |
| Porte-objet cryo | UCS4/ | Techgen |
| Robot de pipetageEpMotion 5075 | EpMotion 5075/ | Eppendorf |
| Robot préparation échantillons | Qiacube/ | Qiagen |
Offres de prestations
- Préparation des ARN, dosage et contrôle qualité.
- Contrôle de non contamination et transcription inverse.
- Design et optimisation des couples en SybrGreen.
- Sélection ou design de sondes TaqMan.
- Réaction de qPCR en microplaque, TaqMan Array ou Open Array.
- Analyse et sélection des gènes de référence.
- Analyse, traitement des données et calcul des variations d'expression du projet de qPCR.
Offres de formations
Prestations :
- conception de projet
- préparation des ARN, dosage et contrôle qualité
- contrôle de non contamination et transcription inverse
- design et optimisation des couples en SybrGreen
- sélection ou design de sondes TaqMan
- réaction de qPCR en microplaque, TaqMan Array ou Open Array
- analyse et sélection des gènes de référence
- analyse, traitement des données et calcul des variations d'expression du projet de qPCR
Département(s) de recherche
- SDV (Sciences de la vie)
Liens PIA
- LabEx LERMIT
Labellisations
- IBISA
Réseaux
- GENOPS (Réseau des plateformes de GENOmique Paris-Saclay)