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CNRGH / Plateforme de séquençage
Plateforme technologique
Au sein de l'Institut de Biologie François Jacob du CEA, le CNRGH (Centre National de Recherche en Génomique Humaine) a pour vocation de répondre aux questions scientifiques posées par la recherche en génétique et en génomique des maladies humaines et possède une expertise reconnue en génotypage et séquençage à haut-débit, grâce au développement et à la mise en ?uvre de technologies innovantes et intégrées. A ce titre, le CNRGH opère une plateforme haut débit de séquençage de pointe. Le laboratoire s'est pourvu récemment de 3 NovaSeq (et opère déjà 5 HiSeq X, 1 HiSeq-4000, 1 NextSeq et 2 MiSeq) et également d'un séquenceur MGI, le DNB-G400. Cet ensemble de séquenceurs permet le séquençage du génome humain entier et d'autres applications tel que l'exome, le transcriptome, l'épigenome. Un suivi permanent des évolutions et développements technologiques permet à la plateforme d'être polyvalente et compétitive afin d'offrir à la communauté scientifique du séquençage aux meilleurs coûts et délais. Le CNRGH peut traiter plusieurs dizaines de milliers d'échantillons chaque année. Afin d'assurer une traçabilité et une qualité optimales, le laboratoire a développé son propre LIMS (Laboratory Information Management System) pour suivre l'ensemble du processus. La plateforme fait partie du réseau national France Génomique. Le CNRGH fait partie du top 3 européens dans le domaine.
Thématiques d'innovation
Laboratoire de rattachement
2, rue Gaston Crémieux
CEA Paris-Saclay, site d'Evry, CNRGH
91057 ÉVRY
Technologies utilisées
séquençage, NGS haut et très haut débitMots clés
- génétique humaine
- génomique humaine
- haut-débit
- séquençage NGS
- épigénétique
- exome
- génome entier
- transcriptome
- méthylome
- développement technologique
- médecine personnalisée
Equipements spécifiques
Nom | Modèle | Marque |
---|---|---|
Fragmentation d'échantillons | LE220, E220/ | COVARIS |
Robot de pipetage JANUS | JANUS/ | PerkinElmer |
Robot de préparation d'échantillons NGS Bravo Workstation | NGS Bravo Workstation/ | Agilent |
Robot de préparation d'échantillons Sciclone G3 NGSx | Sciclone G3 NGSx/ | PerkinElmer |
Robot de préparation d'échantillons Zephyr | Zephyr/ | PerkinElmer |
Séquençage à haut débit HiSeq | HiSeq X Five, HiSeq 2500 upgrade, HiSeq 4000, Novaseq 6000/ | Illumina |
Séquençage à haut débit Minion et Promethion | Minion et Promethion/ | Oxford Nanopore |
Séquençage à haut débit Tape Station | Tape station 4200 et bioanalyzer 2100/ | Agilent |
Séquençage à petit débit / CQ | MiSeq/ | Illumina |
Station de clusterisation | cBot v2/ | Illumina |
Offres de formations
Département(s) de recherche
- SDV (Sciences de la vie)
Liens PIA
- LabEx GenMed
Labellisations
- France Génomique