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CNRGH / Plateforme de séquençage

Plateforme technologique

Description

Au sein de l'Institut de Biologie François Jacob du CEA, le CNRGH (Centre National de Recherche en Génomique Humaine) a pour vocation de répondre aux questions scientifiques posées par la recherche en génétique et en génomique des maladies humaines et possède une expertise reconnue en génotypage et séquençage à haut-débit, grâce au développement et à la mise en ?uvre de technologies innovantes et intégrées. A ce titre, le CNRGH opère une plateforme haut débit de séquençage de pointe. Le laboratoire s'est pourvu récemment de 3 NovaSeq (et opère déjà 5 HiSeq X, 1 HiSeq-4000, 1 NextSeq et 2 MiSeq) et également d'un séquenceur MGI, le DNB-G400. Cet ensemble de séquenceurs permet le séquençage du génome humain entier et d'autres applications tel que l'exome, le transcriptome, l'épigenome. Un suivi permanent des évolutions et développements technologiques permet à la plateforme d'être polyvalente et compétitive afin d'offrir à la communauté scientifique du séquençage aux meilleurs coûts et délais. Le CNRGH peut traiter plusieurs dizaines de milliers d'échantillons chaque année. Afin d'assurer une traçabilité et une qualité optimales, le laboratoire a développé son propre LIMS (Laboratory Information Management System) pour suivre l'ensemble du processus. La plateforme fait partie du réseau national France Génomique. Le CNRGH fait partie du top 3 européens dans le domaine.

Contacts

  • M. Jean-François DELEUZE
  • M. Robert OLASO
  • Mme Céline BESSE

Thématiques d'innovation

Plan et accès

2, rue Gaston Crémieux
CEA Paris-Saclay, site d'Evry, CNRGH
91057 ÉVRY

Equipements et technologies

Technologies utilisées

séquençage, NGS haut et très haut débit

Mots clés

Equipements spécifiques

Nom Modèle Marque
Fragmentation d'échantillons LE220, E220/ COVARIS
Robot de pipetage JANUS JANUS/ PerkinElmer
Robot de préparation d'échantillons NGS Bravo Workstation NGS Bravo Workstation/ Agilent
Robot de préparation d'échantillons Sciclone G3 NGSx Sciclone G3 NGSx/ PerkinElmer
Robot de préparation d'échantillons Zephyr Zephyr/ PerkinElmer
Séquençage à haut débit HiSeq HiSeq X Five, HiSeq 2500 upgrade, HiSeq 4000, Novaseq 6000/ Illumina
Séquençage à haut débit Minion et Promethion Minion et Promethion/ Oxford Nanopore
Séquençage à haut débit Tape Station Tape station 4200 et bioanalyzer 2100/ Agilent
Séquençage à petit débit / CQ MiSeq/ Illumina
Station de clusterisation cBot v2/ Illumina

Prestations & formations

Offres de formations

Ouvert à la formation.

Écosystème

Département(s) de recherche

  • SDV (Sciences de la vie)

Liens PIA

  • LabEx GenMed

Labellisations

  • France Génomique

Écoles doctorales

Life Sciences and Health

Actualités