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CNRGH / Plateforme de génotypage

Plateforme technologique

Description

Au sein de l'Institut de Biologie François Jacob du CEA, le CNRGH (Centre National de Recherche en Génomique Humaine) a pour vocation de répondre aux questions scientifiques posées par la recherche en génétique et en génomique des maladies humaines et possède une expertise reconnue en génotypage et séquençage à haut-débit, grâce au développement et à la mise en oeuvre de technologies innovantes et intégrées. A ce titre, le CNRGH opère une plate-forme de génotypage à très haut-débit basée sur la technologie de puces à ADN Illumina®, et fait partie des 3 leaders européens dans le domaine. Entièrement robotisée, cette plateforme permet de réaliser rapidement des études pan-génomiques sur de grands nombres d'échantillons, grâce à l'utilisation de puces à très haute densité analysant entre 200000 et 5 millions de marqueurs simultanément. Une traçabilité optimale est assurée grâce à un suivi de l'ensemble des échantillons par un système de codes-barres et grâce au pilotage de la plate-forme par l'intermédiaire d'un LIMS (Laboratory Information Management System) traçant l'ensemble des étapes du processus de génotypage. Le débit actuel est de 1200 échantillons d'ADN par semaine, correspondant à la production de plus de 2.000.000.000 de génotypes en moyenne par semaine.

Contacts

  • M. Jean-François DELEUZE
  • M. Robert OLASO

Thématiques d'innovation

Plan et accès

2, rue Gaston Crémieux
CEA Paris-Saclay, site d'Evry, CNRGH
91057 ÉVRY

Equipements et technologies

Technologies utilisées

génotypage sur puces de haute à très haute densité

Mots clés

Equipements spécifiques

Nom Modèle Marque
3 robots scanners iScan +/ Illumina
6 robots de pipetage Evo/ Tecan
Irradiateurs Infinium OmniExpress/ Illumina
Lame haute densité EPIC EPIC (méthylation)/ Illumina
Lame haute densité GSA GSA/ Illumina
Lame haute densité Infinium Human Infinium Human Core Exome/ Illumina
Lame haute densité Infinium Omni2,5 Infinium Omni2.5/ Illumina
Lame haute densité Infinium Omni5,0 Infinium Omni5.0/ Illumina
Lame haute densité iSelect iSelect/ Illumina

Prestations & formations

Offres de formations

Ouvert à la formation.

Écosystème

Département(s) de recherche

  • SDV (Sciences de la vie)

Liens PIA

  • LabEx GenMed

Écoles doctorales

Life Sciences and Health