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CNRGH / Plateforme de génotypage
Plateforme technologique
Au sein de l'Institut de Biologie François Jacob du CEA, le CNRGH (Centre National de Recherche en Génomique Humaine) a pour vocation de répondre aux questions scientifiques posées par la recherche en génétique et en génomique des maladies humaines et possède une expertise reconnue en génotypage et séquençage à haut-débit, grâce au développement et à la mise en oeuvre de technologies innovantes et intégrées. A ce titre, le CNRGH opère une plate-forme de génotypage à très haut-débit basée sur la technologie de puces à ADN Illumina®, et fait partie des 3 leaders européens dans le domaine. Entièrement robotisée, cette plateforme permet de réaliser rapidement des études pan-génomiques sur de grands nombres d'échantillons, grâce à l'utilisation de puces à très haute densité analysant entre 200000 et 5 millions de marqueurs simultanément. Une traçabilité optimale est assurée grâce à un suivi de l'ensemble des échantillons par un système de codes-barres et grâce au pilotage de la plate-forme par l'intermédiaire d'un LIMS (Laboratory Information Management System) traçant l'ensemble des étapes du processus de génotypage. Le débit actuel est de 1200 échantillons d'ADN par semaine, correspondant à la production de plus de 2.000.000.000 de génotypes en moyenne par semaine.
Thématiques d'innovation
Laboratoire de rattachement
2, rue Gaston Crémieux
CEA Paris-Saclay, site d'Evry, CNRGH
91057 ÉVRY
Technologies utilisées
génotypage sur puces de haute à très haute densitéMots clés
- génétique humaine
- génomique humaine
- haut débit
- génotypage
- épigénétique
- développement tecnologique
- médecine personnalisée
Equipements spécifiques
Nom | Modèle | Marque |
---|---|---|
3 robots scanners | iScan +/ | Illumina |
6 robots de pipetage | Evo/ | Tecan |
Irradiateurs | Infinium OmniExpress/ | Illumina |
Lame haute densité EPIC | EPIC (méthylation)/ | Illumina |
Lame haute densité GSA | GSA/ | Illumina |
Lame haute densité Infinium Human | Infinium Human Core Exome/ | Illumina |
Lame haute densité Infinium Omni2,5 | Infinium Omni2.5/ | Illumina |
Lame haute densité Infinium Omni5,0 | Infinium Omni5.0/ | Illumina |
Lame haute densité iSelect | iSelect/ | Illumina |
Offres de formations
Département(s) de recherche
- SDV (Sciences de la vie)
Liens PIA
- LabEx GenMed