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Ingénierie des systèmes complexes et logiciels
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Numérique
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Qualité de vie - Santé - Aliments
Mathématiques et Informatique appliquées, du génome à l'environnement
Unité de recherche UPR 1404
L'unité de recherche MaIAGE regroupe des mathématiciens, des informaticiens, des bioinformaticiens et des biologistes autour de questions de biologie et agro-écologie, allant de l'échelle moléculaire à l'échelle du paysage en passant par l'étude de l'individu, de populations ou d'écosystèmes. L'unité développe des méthodes mathématiques et informatiques motivées par des problèmes biologiques précis. Elle s'implique aussi dans la mise à disposition de bases de données et de logiciels permettant aux biologistes d'utiliser les outils dans de bonnes conditions ou d'exploiter automatiquement la littérature scientifique.
L'inférence statistique et la modélisation dynamique sont des compétences fortes de l'unité, auxquelles s'ajoutent la bioinformatique, la biologie des systèmes, l'algorithmique et l’intelligence artificielle. Les activités de recherche et d'ingénierie s'appuient également sur une forte implication dans les disciplines destinatrices : écologie, environnement et biologie moléculaire.
Positionnement industriel : MaIAGE apporte une expertise aux entreprises confrontées à des données biologiques ou environnementales complexes : biotechnologies, agriculture, santé, environnement, agro-industries, entreprises de logiciels scientifiques. L’unité contribue à résoudre des problématiques de modélisation, d’analyse de données à grande échelle, de prévision ou d’aide à la décision.
Valeur ajoutée : L’unité offre un savoir-faire en modélisation dynamique, en inférence statistique, en bioinformatique et en extraction automatique d’information. Ses équipes conçoivent des méthodes innovantes, des outils logiciels et des plateformes techniques permettant de transformer des données complexes en connaissances actionnables, au service de la recherche publique comme des partenaires socio-économiques.
L'inférence statistique et la modélisation dynamique sont des compétences fortes de l'unité, auxquelles s'ajoutent la bioinformatique, la biologie des systèmes, l'algorithmique et l’intelligence artificielle. Les activités de recherche et d'ingénierie s'appuient également sur une forte implication dans les disciplines destinatrices : écologie, environnement et biologie moléculaire.
Positionnement industriel : MaIAGE apporte une expertise aux entreprises confrontées à des données biologiques ou environnementales complexes : biotechnologies, agriculture, santé, environnement, agro-industries, entreprises de logiciels scientifiques. L’unité contribue à résoudre des problématiques de modélisation, d’analyse de données à grande échelle, de prévision ou d’aide à la décision.
Valeur ajoutée : L’unité offre un savoir-faire en modélisation dynamique, en inférence statistique, en bioinformatique et en extraction automatique d’information. Ses équipes conçoivent des méthodes innovantes, des outils logiciels et des plateformes techniques permettant de transformer des données complexes en connaissances actionnables, au service de la recherche publique comme des partenaires socio-économiques.
Thématiques d'innovation
- Numérique
- Ingénierie des systèmes complexes et logiciels
- Conception logiciel, big-data, cloud, calculs haute performance
- Modélisation et simulation
- Qualité de vie - Santé - Aliments
- Modélisation numérique, visualisation de donnée, Interaction Homme - Machine
- Technologies thérapeutiques (Médicaments, génétique, biomarqueurs, biomolécules...)
- Santé et alimentation animale
- Nouveau modèle production alimentaire (culture, procédé...)
- Qualité et sécurité sanitaire, alimentaire
- Logiciel libre, web
Domaine de Vilvert
78352 JOUY EN JOSAS
Expertises
- bioinformatique et statistique pour les données « omiques »
- biologie des systèmes
- modèles dynamiques et statistiques pour les sciences de la vie et de l'environnement
- acquisition et formalisation de connaissances à partir de texte
- biologie des systèmes
- modèles dynamiques et statistiques pour les sciences de la vie et de l'environnement
- acquisition et formalisation de connaissances à partir de texte
Secteurs d'applications
- Informatique
- Biotechnologies
- Santé / Bien-être
- Agroalimentaire
- Agriculture
- Recherche / Science
- Environnement
Effectif total
Effectif total : 79
Nombre de chercheurs : 24
Nombre de doctorants : 13
Nombre de chercheurs : 24
Nombre de doctorants : 13
Equipements ouverts à la collaboration
Plateforme de bioinformatique MIGALE
L’unité héberge la plateforme de bioinformatique Migale. Cette Infrastructure Scientifique Collective s’inscrit dans le réseau national des plateformes de bioinformatique regroupées au sein de l’Institut Français de Bioinformatique, et fait partie de BioinfOmics, l’Infrastructure de Recherche INRAE en bioinformatique.
http://migale.inrae.fr/
L’unité héberge la plateforme de bioinformatique Migale. Cette Infrastructure Scientifique Collective s’inscrit dans le réseau national des plateformes de bioinformatique regroupées au sein de l’Institut Français de Bioinformatique, et fait partie de BioinfOmics, l’Infrastructure de Recherche INRAE en bioinformatique.
http://migale.inrae.fr/
Mots clés
Offre de valorisation
Ontologies et Corpus :
https://maiage.inrae.fr/ontologies_corpus
https://maiage.inrae.fr/ontologies_corpus
Exemple(s) de travaux
Voir les projets en cours : https://maiage.inrae.fr/contrats-projets
Publications
Relations industrielles et scientifiques
Collaborations scientifiques
• Au niveau national avec Inria, Sorbonne Université, l’Université Paris-Saclay, l’École polytechnique, AgroParisTech, le CNRS, le département MathNum d’INRAE ;
• En Europe avec l’Université de Ghent, University of Edinburgh, University of Vienna, University of Torino, University of Bologna, University of Szeged ;
• À l’international avec le Japon, la Chine, les États-Unis et l’Amérique du Sud.
Etablissements de rattachement
Département(s) de recherche
- Mathématiques
- SDV (Sciences de la vie)
- STIC (Sciences et technologie de l'information et de la communication)