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Numérique
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Qualité de vie - Santé - Aliments
PlantBioinfoPF / Plateforme de bioinformatique
Plateforme technologique
Les services de plate-forme couvrent la conception de bases de données, l'ingénierie logicielle, l'hébergement de logiciels, l'intégration de données et la formation.
L'activité de la plate-forme (système d'information et analyse du génome) est étroitement liée à l'activité de recherche URGI (intégration de données, annotation répétée, structure du génome et dynamique). D'autre part, la plateforme bénéficie de l'expertise de la recherche et de l'analyse des outils de son personnel (principalement des ingénieurs).
La plate-forme développe et maintient un système de génomique (GnpIS) pour la génomique des plantes et des ravageurs afin de permettre aux scientifiques d'extraire des données génomiques et génétiques. GnpIS est accessible via un portail Web public ou en parcourant les données à l'aide d'une recherche rapide («google like search») ou d'outils de recherche avancée (Biomart, Galaxy, Intermine).
Thématiques d'innovation
Laboratoire de rattachement
Route de Saint-Cyr
INRAE, centre de Versailles
78026 VERSAILLES
Technologies utilisées
bioinformatiqueMots clés
Equipements spécifiques
| Nom | Modèle | Marque |
|---|---|---|
| BLAST | ||
| Blaster | ||
| Gnpl S | ||
| High-performance cluster | ||
| Passeur d'échantillons de type CATS (capacité 9 Unipucks) | ||
| REPET | ||
| S-Mart | ||
| Tedna |
Offres de formations
Etablissements de rattachement
Département(s) de recherche
- SDV (Sciences de la vie)
Certifications
- ISO 9001:2015
Labellisations
- ISC INRAE
- IBISA
- France Génomique
Réseaux
- FRANCE GENOMIQUE
- SFBI (Société Française de Bioinformatique)
- PHENOME