• Ingénierie des systèmes complexes et logiciels
  • Qualité de vie - Santé - Aliments

Unité de recherche génomique et bioinformatique (URGI)

Unité de recherche UPR 1164

Description

Le laboratoire URGI est une unité de recherche en génomique et bio-informatique de l'Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), dédiée aux plantes et leurs pathogènes. Ses recherches portent sur l'intégration des données et la structure et la dynamique des génomes. Le laboratoire concoit un système d'information, et développe des outils d'analyses. Ses travaux sont mis à disposition à travers la plateforme URGI du réseau des plateformes de l'Institut Français de Bioinformatique. Certains sont entrepris avec des partenaires industriels importants comme Biogemma ou Florimond-Desprez.

Contacts

  • M. Hadi QUESNEVILLE

https://urgi.versailles.inra.fr/

Thématiques d'innovation

Plan et accès

Route de Saint-Cyr
78026 VERSAILLES

Nos domaines de recherche

Expertises

- intégration des données
- annotation des répétitions d'ADN
- structure et dynamique génomique

Secteurs d'applications

  • Informatique
  • Agriculture
  • Agroalimentaire
  • Biotechnologies

Effectif total

Effectif total : 36
Nombre de chercheurs : 3
Nombre de doctorants : 1

Equipements ouverts à la collaboration

Académique et industrielle :
- cluster de calcul, système d'information pour la génétique et génomique des plantes

Mots clés

Nos résultats

Offre de valorisation

- annotation des éléments transposables
- intégration de données génomique et génétique
- système d'information plantes et leurs bioagresseurs

Exemple(s) de travaux

Projets en cours à l'URGI : https://urgi.versailles.inra.fr/Projects

Publications

https://urgi.versailles.inra.fr/

Relations industrielles et scientifiques

Collaborations scientifiques

CIRAD, CNRS, WHEAT INITIATIVE, IWGSC, EBI

Collaborations privées

Biogemma, Florimond-Desprez

Écosystème

Etablissements de rattachement

INRAE

Groupements institutionnels

  • Réseau - AMAIZING
  • Réseau - AKER
  • Réseau - PHENOME
  • Réseau - FRANCE GENOMIQUE

Département(s) de recherche

  • SDV (Sciences de la vie)

Pôles de compétitivités

  • Céréale vallée

Demande de modification

Vous entrez dans le mode de « demande de modification ».
Après avoir envoyé vos modifications, elles seront d’abord validées par l’équipe Plug in labs Université Paris Saclay, avant d’apparaître sur la plateforme.

Thématiques

Thématiques actuelles

  • Ingénierie des systèmes complexes et logiciels
    • Conception logiciel, big-data, cloud, calculs haute performance
  • Qualité de vie - Santé - Aliments
    • Nouveau modèle production alimentaire (culture, procédé...)
    • Qualité et sécurité sanitaire, alimentaire
Titre

Contenu actuel

Unité de recherche génomique et bioinformatique (URGI)
Type

Contenu actuel

Unité de recherche
Effectif

Contenu actuel

Effectif total : 36
Nombre de chercheurs : 3
Nombre de doctorants : 1
Description

Contenu actuel

Le laboratoire URGI est une unité de recherche en génomique et bio-informatique de l'Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), dédiée aux plantes et leurs pathogènes. Ses recherches portent sur l'intégration des données et la structure et la dynamique des génomes. Le laboratoire concoit un système d'information, et développe des outils d'analyses. Ses travaux sont mis à disposition à travers la plateforme URGI du réseau des plateformes de l'Institut Français de Bioinformatique. Certains sont entrepris avec des partenaires industriels importants comme Biogemma ou Florimond-Desprez.
Infos de contact
Contact

Contenu actuel

Nom du contact Email Téléphone
Hadi-QUESNEVILLE hadi.quesneville@inrae.fr
URL

Contenu actuel

https://urgi.versailles.inra.fr/

Adresse

Contenu actuel

Route de Saint-Cyr

78026 VERSAILLES
Laboratoires de rattachement

Contenu actuel

Mots clés

Contenu actuel

espèce végétale, plante, bioinformatique, génomique, annotation génomique, intégration des données, analyse haut débit, cartographie, transcriptome, puce à ADN, polymorphisme, variabilité allélique, SNP
Nos domaines de recherche
Expertises

Contenu actuel

- intégration des données
- annotation des répétitions d'ADN
- structure et dynamique génomique
Secteurs d'applications

Contenu actuel

Agriculture

Agroalimentaire

Biotechnologies

Informatique

Equipements ouverts à la collaboration

Contenu actuel

Académique et industrielle : - cluster de calcul, système d'information pour la génétique et génomique des plantes
Nos résultats
Offre de valorisation

Contenu actuel

- annotation des éléments transposables - intégration de données génomique et génétique - système d'information plantes et leurs bioagresseurs
Types d'offres

Contenu actuel

Exemple(s) de travaux

Contenu actuel

Projets en cours à l'URGI : https://urgi.versailles.inra.fr/Projects
Publications

Contenu actuel

https://urgi.versailles.inra.fr/
Collaborations scientifiques

Contenu actuel

CIRAD, CNRS, WHEAT INITIATIVE, IWGSC, EBI
Collaborations privées

Contenu actuel

Biogemma, Florimond-Desprez
Écosystème
Etablissements de rattachement

Contenu actuel

INRAE
Groupements institutionnels

Contenu actuel

Réseau - AMAIZING Réseau - AKER Réseau - PHENOME Réseau - FRANCE GENOMIQUE
Département(s) de recherche

Contenu actuel

SDV (Sciences de la vie)
Liens PIA

Contenu actuel

Pôles de compétitivité

Contenu actuel

Céréale vallée
Institut Carnot

Contenu actuel

Ecoles doctorales

Contenu actuel

Retour en haut de page