• Ingénierie des systèmes complexes et logiciels
  • Qualité de vie - Santé - Aliments

Unité de recherche génomique et bioinformatique (URGI)

Unité de recherche UPR 1164

Description

Etudier les plantes au niveau génétique et génomique, mieux connaître les pathogènes des végétaux : ce sont les missions des scientifiques de l’URGI, l’Unité de Recherche en Génomique et bio-Informatique, au sein du département Biologie et amélioration des plantes d’INRAE, l’Institut National de Recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement. Implantée à Versailles-Saclay, l’unité de recherche développe des outils et des connaissances sur la structure, le fonctionnement et l’évolution du génome. Elle accueille également la plateforme bio-informatique PlantBioinfoPF.

Contacts

  • M. Michael ALAUX
  • Mme Anne-Françoise ADAM-BLONDON

https://urgi.versailles-grignon.hub.inrae.fr/

Thématiques d'innovation

Plan et accès

Route de Saint-Cyr
78026 VERSAILLES

Nos domaines de recherche

Expertises

- intégration des données
- annotation des répétitions d'ADN
- structure et dynamique génomique

Secteurs d'applications

  • Informatique
  • Biotechnologies
  • Agroalimentaire
  • Agriculture

Effectif total

Effectif total : 36
Nombre de chercheurs : 3
Nombre de doctorants : 1

Equipements ouverts à la collaboration

Académique et industrielle :
- cluster de calcul, système d'information pour la génétique et génomique des plantes

Mots clés

Nos résultats

Offre de valorisation

- annotation des éléments transposables
- intégration de données génomique et génétique
- système d'information plantes et leurs bioagresseurs

Exemple(s) de travaux

Projets en cours à l'URGI : https://urgi.versailles.inra.fr/Projects

Publications

https://urgi.versailles.inra.fr/

Relations industrielles et scientifiques

Collaborations scientifiques

CIRAD, CNRS, WHEAT INITIATIVE, IWGSC, EBI

Collaborations privées

Biogemma, Florimond-Desprez

Écosystème

Etablissements de rattachement

INRAE

Groupements institutionnels

  • Réseau - AMAIZING
  • Réseau - AKER
  • Réseau - PHENOME
  • Réseau - FRANCE GENOMIQUE

Département(s) de recherche

  • SDV (Sciences de la vie)

Pôles de compétitivités

  • Céréale vallée

Demande de modification

Vous entrez dans le mode de « demande de modification ».
Après avoir envoyé vos modifications, elles seront d’abord validées par l’équipe Plug in labs Université Paris Saclay, avant d’apparaître sur la plateforme.

Thématiques

Thématiques actuelles

  • Ingénierie des systèmes complexes et logiciels
    • Conception logiciel, big-data, cloud, calculs haute performance
    • Conception logiciel, big-data, cloud, calculs haute performance
  • Qualité de vie - Santé - Aliments
    • Nouveau modèle production alimentaire (culture, procédé...)
    • Nouveau modèle production alimentaire (culture, procédé...)
    • Qualité et sécurité sanitaire, alimentaire
    • Qualité et sécurité sanitaire, alimentaire
Titre

Contenu actuel

Unité de recherche génomique et bioinformatique (URGI)
Type

Contenu actuel

Unité de recherche
Effectif

Contenu actuel

Effectif total : 36
Nombre de chercheurs : 3
Nombre de doctorants : 1
Description

Contenu actuel

Etudier les plantes au niveau génétique et génomique, mieux connaître les pathogènes des végétaux : ce sont les missions des scientifiques de l’URGI, l’Unité de Recherche en Génomique et bio-Informatique, au sein du département Biologie et amélioration des plantes d’INRAE, l’Institut National de Recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement. Implantée à Versailles-Saclay, l’unité de recherche développe des outils et des connaissances sur la structure, le fonctionnement et l’évolution du génome. Elle accueille également la plateforme bio-informatique PlantBioinfoPF.
Infos de contact
Contact

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Nom du contact Email Téléphone
Michael-ALAUX contact-plantbioinfopf@inrae.fr
Anne-Françoise-ADAM-BLONDON anne-francoise.adam-blondon@inrae.fr
URL

Contenu actuel

https://urgi.versailles-grignon.hub.inrae.fr/

Adresse

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Route de Saint-Cyr

78026 VERSAILLES
Laboratoires de rattachement

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Mots clés

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espèce végétale, plante, bioinformatique, génomique, annotation génomique, intégration des données, analyse haut débit, cartographie, transcriptome, puce à ADN, polymorphisme, variabilité allélique, SNP
Nos domaines de recherche
Expertises

Contenu actuel

- intégration des données
- annotation des répétitions d'ADN
- structure et dynamique génomique
Secteurs d'applications

Contenu actuel

Agriculture

Agroalimentaire

Biotechnologies

Informatique

Equipements ouverts à la collaboration

Contenu actuel

Académique et industrielle : - cluster de calcul, système d'information pour la génétique et génomique des plantes
Nos résultats
Offre de valorisation

Contenu actuel

- annotation des éléments transposables - intégration de données génomique et génétique - système d'information plantes et leurs bioagresseurs
Types d'offres

Contenu actuel

Exemple(s) de travaux

Contenu actuel

Projets en cours à l'URGI : https://urgi.versailles.inra.fr/Projects
Publications

Contenu actuel

https://urgi.versailles.inra.fr/
Collaborations scientifiques

Contenu actuel

CIRAD, CNRS, WHEAT INITIATIVE, IWGSC, EBI
Collaborations privées

Contenu actuel

Biogemma, Florimond-Desprez
Écosystème
Etablissements de rattachement

Contenu actuel

INRAE
Groupements institutionnels

Contenu actuel

Réseau - AMAIZING Réseau - AKER Réseau - PHENOME Réseau - FRANCE GENOMIQUE
Département(s) de recherche

Contenu actuel

SDV (Sciences de la vie)
Liens PIA

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Pôles de compétitivité

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Céréale vallée
Institut Carnot

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Ecoles doctorales

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Informations personnelles
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