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Qualité de vie - Santé - Aliments
INRAE / Infectiologie Expérimentale des Rongeurs et Poissons (IERP)
Plateforme technologique
L'infrastructure scientifique collective IERP, labélisée IBISA, a pour principales missions la production et la fourniture d'animaux à statut sanitaire et génétique défini, la réalisation d'expérimentation in vivo en milieu confiné et le phénotypage des animaux en expérimentation. Ouverte à la communauté, elle a un rôle d'interface entre les laboratoires académiques, les industriels et les acteurs de la filière et offre des services standards ou à façon. Les projets hébergés couvrent les domaines de l'infectiologie, l'immunologie, la génétique, la physiologie et le lien entre hôte - microbe et environnement. Les spécificités de l'infrastructure sont donc son ouverture, son expertise en infectiologie associée à la fourniture d'accès à des locaux confinés (NSB2) pour la manipulation d'agents pathogènes et d'OGM; sa pisciculture expérimentale hors sol hébergeant des espèces aquacoles (truite et carpe) et des poissons-zèbres. Le plateau de phénotypage comprend des équipements de pointe distribués au sein même des dispositifs pour limiter le stress lié au transport des animaux et éviter les ruptures de confinement lors des expériences en NSB2. Les technologies proposées couvrent les besoins en imagerie in vivo (à fluorescence et bioluminescence), en transparisation et imagerie à feuille de lumière, en cytométrie d'organismes biologiques complexes (larves de poissons zèbres, organoïdes) et les études comportementales (systèmes home made, Noldus, Viewpoint). L'infrastructure est partie intégrante de réseaux thématiques (Emerg'in, Aquaexcel 3.0, Frontinov, PAHW, InnaSCo) et disciplinaires (RmuI, ImaBio, Rt-mfm, SBEA) nationaux et internationaux.
Thématiques d'innovation
Domaine de Vilvert
IERP, INRAE, centre de Jouy-en-Josas
78352 JOUY-EN-JOSAS
Technologies utilisées
- production et experimentation animale- infectiologie multiespèce
- imagerie avancée en milieu confiné
Mots clés
- aquaculture
- infectiologie
- immunologie
- EOPS
- imagerie
- truite
- zebrafish
- carpe
- rongeurs
- souris
- virus
- bactéries
- prions
- télémétrie
- lignées isogénique
- lignées transgénique
- NSB2
- NSB3
- deux photons
- IVIS
- OGM
- zootechnie
- circuits fermés recyclés
- installations expérimentales
- phénotypage
Equipements spécifiques
| Nom | Modèle | Marque |
|---|---|---|
| 2 zones expérimentales de confinement niveau 3 | ||
| Plateforme de phénotypage par imagerie des poissons | Loupes de stéréomicroscopie à fluorescence, microscope deux -photons/ | Leica |
| Zone EOPS | ||
| Zone expérimentale de niveau 2 (pisciculture expérimentale) | ||
| Zone protégée d'élevage EOPS |
Offres de prestations
- Modèles murins (souris et rats) et aquacoles (truites, zebrafish, carpes, autres à la demande)
- Statuts génétiques définis (Standards, isogéniques, mutants), centre de référence pour les lignées de souris « prionisées »
- Statuts conventionnels, EOPS, gnotobiotiques
- Elevage en circuit fermé recyclé (5 à 25°C)
- Pilotage de croissance (distributeurs automatiques)
* Mise en ?uvre de protocole en infectiologie multi-espèces : rongeurs et poissons
- Zones d'expérimentation et laboratoires en environnement NSB2 et NSB3
- Equipements de micro-injections (injecteurs, micromanipulateurs, stéréomicroscopes)
- Incubateurs thermorégulés - Espaces d'hébergements cloisonnés ou individualisés pour l'étude de pathogènes
- Zootechnie /suivi des animaux infectés (relevé de mortalité, traitement)
- Disponibilité de quelques pathogènes dans le cadre de projets collaboratifs :
- virus d'aquaculture (VHSV, IHNV, SVCV, IPN, VMS, AIS) ou virus humain (RSV, HSV, ZYKA, SINDBIS, INFLUENZA)
- bactéries : FLAVOBACTERIUM PSYCHROPHILUM (mode d'infection unique par balnéation), AEROMONAS SALMONICIDA, ENTORROCOCCUS, STAPHILOCCOCUS AUREUS
- Prions: souches multi-espèces (ovine, bovine, humaine, hamster, ?)
* Plateforme de phénotypage du poisson zèbre par imagerie
Infectiologie
- Développement de modèles infectieux à façon (viraux/bactériens)
- Phénotypage par imagerie (3D et 3D+t) pour le suivi du pathogène fluorescent et des réponses immunitaires associées (lignées transgéniques de référence)
- Criblage d'anti-infectieux (toxicité/efficacité)
- Analyse de données
Modèles d'inflammation
- Différents stimuli (pharmacologique, infectieux, lésions mécaniques, photoablation ....)
- Phénotypage par imagerie (3D/3D+t) pour le suivi de la réaction inflammatoire/de la régénération tissulaire
- Criblage de molécules anti-inflammatoires (toxicité/efficacité)
- Analyse des données : reconstruction 3D, segmentation, tracking, quantification....
IHC in toto, transparisation et imagerie 3D de tissus épais
- A partir de tissus fixés :
- immunohistochimie in toto
- clarification (RIMS, CUBIC, DISCO, ... )
- imagerie 3D sur tissus épais (2 photon/Light Sheet)
- analyse d'images (reconstruction 3D, segmentation, quantification...
Ce service est disponible pour plusieurs espèces poissons (zebrafish adulte, truites et carpes) ainsi que pour des tissus de mammifères sur des thématiques en lien avec des projets infectiologie/inflammation.
Innovation
La plateforme investit en R&D pour proposer des services innovants basés sur des technologies de pointe.
Les projets en cours sont :
- la production de poisson-zèbre à flore contrôlée (horizon 2020)
- la mise en place d'un pipe-line de phénotypage "immunologique" de lignées de poisson-zèbre associant : infectiologie expérimentale, criblage de molécules thérapeutiques, et phénotypage par imagerie
- le développement de nouvelles techniques d'imagerie 3D (IHC, transparisation, imagerie, analyse d'images) pour l? étude anatomopathologique des maladies infectieuses des poissons d'élevage (carpes et truites)
- le développement d'outils et de protocoles pertinents pour l'étude de nouveaux aliments destinés à l'aquaculture (probiotiques, bactériophages, insectes, levures, algues...) : zootechnie, effets immunostimulants lors de challenges infectieux : (flavobactérie) et mesure de l'impact sur le microbiote.
Offres de formations
- Tutorat des étudiants (Thésards, master) pour la mise en ?uvre des techniques expérimentales (infection, prélèvements, transfert d'embryons?)
Imagerie :
- Formation annuelle CNRS. Formation: Clarification pour l'imagerie tridimensionnelle d'objets biologiques complexes.
Formations You&Science :
- Modèles d'infections virales pour l'étude des relations hôte-pathogène
- Clarification pour l'imagerie tri-dimensionnelle du zebrafish au cours du développement
- Atelier pédagogique à l'école thématique MifoBio
Département(s) de recherche
- SDV (Sciences de la vie)
Labellisations
- ISC INRAE
- IBISA