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Qualité de vie - Santé - Aliments
INRA / US EPGV- Etude du Polymorphisme des Genomes Végétaux
Plateforme technologique
Les grands enjeux de l'amélioration des espèces végétales sont l'analyse de la diversité et de l'évolution des gènes et des génomes, la mise en évidence des facteurs contrôlant des caractères d'intérêt agronomique et/ou adaptatif (cartographie génétique de QTL, génétique d'association), la sélection assistée par marqueurs, la sélection génomique.
-Développer des protocoles adaptés aux spécificités des espèces végétales (taille des génomes, autogamie, allogamie, large variabilité génétique, polyploïdie,?) en fonction des évolutions technologiques disponibles sur les plateformes de l'Institut de Génomique
-Mettre à la disposition de différentes équipes (INRA, CIRAD,?) des outils de séquençage et de génotypage à haut débit afin de répondre aux besoins de leurs programmes scientifiques
-Etablir en collaboration avec les bio-informaticiens les processus et les outils pour l'analyse et la gestion des données de polymorphisme
-Participer au réseau des différentes plateformes de génomique et plus particulièrement de l'infrastructure nationale "France Génomique" dont l'EPGV est partenaire
- Mme Marie-Christine LE PASLIER
- Mme Aurélie BERARD
Thématiques d'innovation
2, rue Gaston Crémieux
CEA Paris-Saclay, site d'Evry, Unité EPGV (US 1279)
91057 ÉVRY
Technologies utilisées
génomiqueMots clés
Equipements spécifiques
| Nom | Modèle | Marque |
|---|---|---|
| Fraisage 3 axes | ||
| Illumina HiSeq 2000, 2500 Rapid Run, MiSeq | ||
| Infinium iSelect | ||
| Ion-Torrent PGM, Proton | ||
| iPlex MassARRAY Analyser 4 | ||
| iPlex Nanodispenser RS1000 | ||
| Roche GS-Junionr, GS-FLX | ||
| TaqMan ABI 7900HT |
Offres de formations
Etablissements de rattachement
Département(s) de recherche
- SDV (Sciences de la vie)
Réseaux
- GENOPS (Réseau des plateformes de GENOmique Paris-Saclay)