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Qualité de vie - Santé - Aliments
IDMIT / Equipe d'informatique et bioinformatique (IBI)
Plateforme technologique
![](https://craft.bdi.fr/shared/6cb44afb-56e5-4b8b-9b1c-4df8c155d545/champ_915078_821.jpg)
Au sein du département IDMIT de l'institut François Jacob, l'équipe IBI développe et maintient depuis 2012 un logiciel de gestion de données de laboratoire (LIMS) nommé BATLab.
Grâce à sa situation et aux interactions quotidiennes avec les acteurs de l'immunologie, il est devenu la clé de voute de l'organisation d'IDMIT.
Les nombreux projets de nos différents laboratoires y sont planifiés des mois à l'avance pour gérer et optimiser le calendrier de nos plateformes, tout en gardant une grande flexibilité pour s'adapter aux besoins de dernière minute, dont le récent COVID-19.
La gestion de nos animaleries primates (A1, A2, A3, A3 aéro) y est également essentielle, et la préoccupation du bien-être animal (AAALAC) est omniprésente.
Notre activité repose également sur une gestion critique de notre centre de ressources biologiques (CRB) et nos stocks de réactifs, anticorps, médicaments, (...) ou autre pathogènes. Les Micro-Organismes et Toxines (MOT) et les études s'y rapportant y sont par ailleurs gérés avec une attention particulière qui a pleinement satisfait l'ANSM.
Les résultats d'expérience des différentes plateformes (cytométrie, multiplex, charges virales, nfs ?) y sont hébergés et visualisés ? comme le reste des informations du LIMS ? à l'aide du logiciel de visualisation de données Tableau Software.
En fin de pipeline, BATLab gère finalement certains aspects de facturation et d'unités d'?uvre, dont les couts d'hébergement des animaux pour les différents projets.
- M. Roger LE GRAND
- M. Frédéric DUCANCEL
- M. Brice TARGAT
Thématiques d'innovation
Laboratoire de rattachement
18, route du Panorama
CEA Paris-Saclay, site de Fontenay-aux-Roses, IDMIT
92265 FONTENAY-AUX-ROSES
Technologies utilisées
Bioinformatique : Langage R (CytoCompare, SpadeVizR), CytoBank, SPADEDéveloppement LIMS : Apache, PHP, MySQL, HTML5, JQuery, Bootstrap4
Outils : Git, GitLab, Asana, Slack
Visualisation de données : Tableau Software
Mots clés
Equipements spécifiques
Nom | Modèle | Marque |
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Stations de travail (4) Precision 7910 | Precision 7910 (80 Go de RAM)/ | DELL |
Stations de travail (4) Precision 7920 | Precision 7920 (128 Go de RAM, carte graphique Nvidia RTX2080)/ | DELL |
Offres de prestations
Offres de formations
Département(s) de recherche
- SDV (Sciences de la vie)
Certifications
- ISO 9001:2015
Labellisations
- IBISA