ICSN / Souchothèque

La souchothèque ICSN est une banque rassemblant plus de 1 200 micro-organismes symbiotiques. L'identification des champignons est réalisée par amplification de la région ITS4 ou ITS1 de l'ADNr et les isolats bactériens sont identifiés sur la base des analyses de séquences 16S d'ADNr. Les séquences sont alignées avec les séquences d'ADN de GenBank, NCBI, en utilisant BLASTN 2.2.28 et sont déposées dans GenBank pour les numéros d'accession. Les souches sont conservées en triplicat à -80°C. À partir de ces souches, des extraits standardisés sont générés par culture sur milieu solide PDA puis extraction à l'acétate d'éthyle. Ces extraits sont ensuite répartis dans des plaques multi-puits afin d'être criblés sur différentes cibles biologiques. Une base de données est associée à la souchothèque ICSN et indique les hôtes à partir desquels les micro-organismes ont été isolés, leurs identifications, les extraits générés, les données relatives aux essais biologiques, et les programmes de recherches pour lesquels chaque souche a été isolée et/ou identifiée. Une partie de ces extraits de micro-organismes est inscrite dans l'extractothèque et consultable par l'ensemble de la communauté scientifique.

• Mme Véronique EPARVIER