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GENOSCOPE / Plate-forme MicroScope - Annotation et analyses comparatives de génomes microbiens - Genopole
Plateforme technologique
MicroScope est une plate-forme Web dédiée à l'annotation et à l'exploration des fonctions des gènes microbiensgrâce à des analyses comparatives génomiques, pangénomiques et métaboliques. La plateforme prend en charge l'intégration de génomes et de métagénomes nouvellement assemblés et fournit également des services d'analyse de données de séquençage à haut débit pour la transcriptomique et la recherche de variants.L'interface utilisateur de MicroScope permet un travail collaboratif au sein d'un contexte comparatif riche afin d'améliorer l'effort de curation par la communauté.
Thématiques d'innovation
Laboratoire de rattachement
2, rue Gaston Crémieux
CEA Paris-Saclay, site d'Evry, GENOSCOPE / Génomique métabolique du Génoscope, UMR 8030
91000 ÉVRY
Equipements spécifiques
| Nom | Modèle | Marque |
|---|---|---|
| Analyse de données de transcriptomique. | ||
| Annotation de génomes microbiens (génomes et metagénomes assemblés). | ||
| Assistance technique. | ||
| Formations à l'annotation de génomes procaryotes et à la curation de réseaux métaboliques. | ||
| Génomique comparative et pangénomique. | ||
| Prédiction de fonctions et de processus biologiques. | ||
| QTOF | ||
| Recherche de variants dans des souches évoluées. |
Offres de prestations
https://mage.genoscope.cns.fr/microscope/about/services.php
Offres de formations
- "Annotation et analyse des génomes procaryotes à l'aide de la plateforme MicroScope" : cette formation de 4,5 jours a pour objectif de présenter les fonctionnalités de la plateforme Microscope aux nouveaux utilisateurs.
- "Plateforme MicroScope - Cours avancé" : cette formation de 2 jours vise à présenter les derniers développements de la plate-forme MicroScope aux utilisateurs ayant déjà suivi une formation il y a quelques années.
Pour plus d'informations ou s'inscrire:
https://labgem.genoscope.cns.fr/professional-trainings/microscope-professional-trainings/" " target=""_blank"">https://labgem.genoscope.cns.fr/professional-trainings/microscope-professional-trainings/
Etablissements de rattachement
Département(s) de recherche
- SDV (Sciences de la vie)
Certifications
- ISO 9001:2015
- NFX 50-900 :2016