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Qualité de vie - Santé - Aliments
DRCM / Plateforme de Cytogénétique (PF-CytoG)
Plateforme technologique
La plateforme de cytogénétique, PF-CytoG, du Département de Radiobiologie Cellulaire et Moléculaire (DRCM) du CEA est spécialisée dans l’analyse des chromosomes et de leurs anomalies, qu’elles soient numériques ou structurales. La plateforme met son expertise à disposition des équipes scientifiques académiques et industrielles en proposant des prestations de cytogénétique adaptées à divers projets de recherche.
Les analyses cytogénétiques réalisées contribuent à la caractérisation des cellules traitées par des molécules chimiques ou issues d’ingénierie génétique, et assurent le contrôle qualité de la stabilité chromosomique au cours des cultures cellulaires. A partir de différents types d’échantillons (lignées cellulaires, cultures primaires, cellules souches pluripotentes iPSC, sang, organoïdes), la plateforme réalise des étalements de chromosomes métaphasiques et met en oeuvre plusieurs techniques de cytogénétique moléculaire par Fluorescent In Situ Hybridization (FISH). Elle propose notamment d’établir le caryotype par Multi-FISH (M-FISH) à l’aide de sondes commerciales, ainsi que l’analyse ciblée de régions chromosomiques spécifiques (télomères, centromères). Ces approches permettent d’étudier les réarrangements chromosomiques, et les aberrations télomériques, de suivre l’évolution de la taille des séquences télomériques par Télo/Centro-FISH, et d’analyser les recombinaisons télomériques entre chromatides sœurs par Chromosome Orientation-FISH (CO-FISH).
La plateforme réalise également des techniques de cytogénétique conventionnelle comme la coloration Giemsa, qui, combinée à l’incorporation d’analogue de thymidine, permet de suivre les échanges entre chromatides sœurs (SCE), un marqueur de la toxicologie génétique d’un produit.
La plateforme qui travaille avec une enceinte climatique garantissant la qualité et la reproductibilité des étalements de chromosomes métaphasiques, dispose d’un équipement de pointe incluant un microscope Zeiss Imager.Z2, un bras robotisé et des logiciels spécialisés permettant la détection automatisée des métaphases et l’acquisition d’images à haut débit avec une capacité allant jusqu’à 80 lames.
Enfin, la plateforme Cyto-G travaille en étroite collaboration avec les autres plateformes du DRCM afin de proposer des solutions intégrées et sur mesure, adaptées aux besoins scientifiques de chaque projet.
Les analyses cytogénétiques réalisées contribuent à la caractérisation des cellules traitées par des molécules chimiques ou issues d’ingénierie génétique, et assurent le contrôle qualité de la stabilité chromosomique au cours des cultures cellulaires. A partir de différents types d’échantillons (lignées cellulaires, cultures primaires, cellules souches pluripotentes iPSC, sang, organoïdes), la plateforme réalise des étalements de chromosomes métaphasiques et met en oeuvre plusieurs techniques de cytogénétique moléculaire par Fluorescent In Situ Hybridization (FISH). Elle propose notamment d’établir le caryotype par Multi-FISH (M-FISH) à l’aide de sondes commerciales, ainsi que l’analyse ciblée de régions chromosomiques spécifiques (télomères, centromères). Ces approches permettent d’étudier les réarrangements chromosomiques, et les aberrations télomériques, de suivre l’évolution de la taille des séquences télomériques par Télo/Centro-FISH, et d’analyser les recombinaisons télomériques entre chromatides sœurs par Chromosome Orientation-FISH (CO-FISH).
La plateforme réalise également des techniques de cytogénétique conventionnelle comme la coloration Giemsa, qui, combinée à l’incorporation d’analogue de thymidine, permet de suivre les échanges entre chromatides sœurs (SCE), un marqueur de la toxicologie génétique d’un produit.
La plateforme qui travaille avec une enceinte climatique garantissant la qualité et la reproductibilité des étalements de chromosomes métaphasiques, dispose d’un équipement de pointe incluant un microscope Zeiss Imager.Z2, un bras robotisé et des logiciels spécialisés permettant la détection automatisée des métaphases et l’acquisition d’images à haut débit avec une capacité allant jusqu’à 80 lames.
Enfin, la plateforme Cyto-G travaille en étroite collaboration avec les autres plateformes du DRCM afin de proposer des solutions intégrées et sur mesure, adaptées aux besoins scientifiques de chaque projet.
Thématiques d'innovation
18 route du Panorama
Commissariat à l’Energie Atomique et aux Energies Alternatives - Paris-Saclay, site de Fontenay-aux-Roses, DRF/JACOB/DRCM/PF-CytoG
92265 Fontenay-aux-Roses
Technologies utilisées
Culture cellulaire (lignée cellulaire, culture primaire, iPSC), Etalement de chromosomes métaphasiques, Caryotypape (Multi-FISH), Détection des réarrangements chromosomiques et des aberrations télomériques (Telo/Centro-FISH), Echange entre chromatides sœurs (SCE), Recombinaison télomérique entre chromatides sœurs (CO-FISH), Immunomarque combiné au FISH, Détection automatisée de métaphases, Microscopie automatisée à haut débit (jusqu’à 80 lames) pour l’acquisition d’images en lumière transmisse ou en fluorecence.Mots clés
- Etalement de chromosomes métaphasiques
- Détection automatisée des métaphases
- Caryotype
- M-FISH
- Télomère
- Centromère
- Télomère-Centromère-FISH
- CO-FISH
- Echange entre chromatides sœurs
- SCE
- Aberration chromosomique
- Aberration télomérique
Equipements spécifiques
| Nom | Modèle | Marque |
|---|---|---|
| Plateforme détection de métaphases et d’imagerie de 80 lames | Metasystems | Metasystems |
| Microscope droit motorisé | Axio Imager.Z2 | ZEISS |
| Enceinte climatique | CDS-5 | Thermotron |
| Logiciel détection des métaphases | V3.12.9 | Metasystems |
| Logiciel In Situ Imaging System (ISIS) pour l’analyse de FISH | V5.8.13 | Metasystems |
Lien vers les équipements
Types de prestations
- Collaboration de R&D
Offres de prestations
La plateforme CytoG propose diverses prestations : - mise au point ou optimisation du protocole de préparation des chromosomes métaphasiques à partir de différents échantillons humains ou murins (lignée cellulaire, culture primaire, cellule issue d’ingénierie génétique, iPSC, organoïde, …), - réalisation de techniques de cytogénétique moléculaire pour établir le caryotype (Multi-FISH), analyser les aberrations chromosomiques et/ou télomériques, suivre l’évolution de la taille des télomères (Telomere-Centromere-FISH), étudier les recombinaisons entres chromatides soeurs (SCE) ou les recombinaisons télomériques entre chromatides soeurs (CO-FISH), - acquisition automatisée d’images en lumière transmise ou en fluorescence par microscopie à haut-débit (jusqu’à 80 lames) avec recherche automatique des métaphases, analyse des données de cytogénétiques, - formation des étudiants, des chercheurs et des professionnels.
Offres de formations
La plateforme CytoG qui accueille des étudiants, des chercheurs et des professionnels propose des formations pratiques pour la préparation des chromosomes métaphasiques à partir d’échantillons variés, leurs marquages par les différentes techniques de cytogénétique conventionnelle ou moléculaire (caryotypage, M-FISH, FISH, télomère/centromère-FISH, CO-FISH, SCE, Giemsa), l’acquisition automatisée d’images avec recherche de métaphases et l’analyse des données afin d’étudier le caryotype des cellules, sa stabilité ou ses remaniements, la stabilité des télomères et l’évolution de leur taille. Ces formations, adaptées à tous les niveaux, permettront aux participants de gagner en autonomie, en rapidité et en puissance d’analyse, tout en bénéficiant des technologies de la plateforme CytoG et de l’expertise de son personnel.
Etablissements de rattachement
Département(s) de recherche
- SDV (Sciences de la vie)
Certifications
- Autre