• Innovation Sociale - Sociétale - Solidaire
  • Qualité de vie - Santé - Aliments

CNRGH / Plateforme de séquençage

Plateforme technologique

Description

Au sein de l'Institut de Biologie François Jacob du CEA, le CNRGH (Centre National de Recherche en Génomique Humaine) a pour vocation de répondre aux questions scientifiques posées par la recherche en génétique et en génomique des maladies humaines et possède une expertise reconnue en génotypage et séquençage à haut-débit, grâce au développement et à la mise en ?uvre de technologies innovantes et intégrées. A ce titre, le CNRGH opère une plateforme haut débit de séquençage de pointe. Le laboratoire s'est pourvu récemment de 3 NovaSeq (et opère déjà 5 HiSeq X, 1 HiSeq-4000, 1 NextSeq et 2 MiSeq) et également d'un séquenceur MGI, le DNB-G400. Cet ensemble de séquenceurs permet le séquençage du génome humain entier et d'autres applications tel que l'exome, le transcriptome, l'épigenome. Un suivi permanent des évolutions et développements technologiques permet à la plateforme d'être polyvalente et compétitive afin d'offrir à la communauté scientifique du séquençage aux meilleurs coûts et délais. Le CNRGH peut traiter plusieurs dizaines de milliers d'échantillons chaque année. Afin d'assurer une traçabilité et une qualité optimales, le laboratoire a développé son propre LIMS (Laboratory Information Management System) pour suivre l'ensemble du processus. La plateforme fait partie du réseau national France Génomique. Le CNRGH fait partie du top 3 européens dans le domaine.

Contacts

  • Doris LECHNER

Thématiques d'innovation

Laboratoire de rattachement

Plan et accès

2, rue Gaston Crémieux
CEA Paris-Saclay, site d'Evry, CNRGH
91057 ÉVRY

Equipements et technologies

Technologies utilisées

séquençage, NGS haut et très haut débit

Mots clés

Equipements spécifiques

Nom Modèle Marque
Fragmentation d'échantillons LE220, E220 COVARIS
Robot de pipetage JANUS JANUS PerkinElmer
Robot de préparation d'échantillons NGS Bravo Workstation NGS Bravo Workstation Agilent
Robot de préparation d'échantillons Sciclone G3 NGSx Sciclone G3 NGSx PerkinElmer
Robot de préparation d'échantillons Zephyr Zephyr PerkinElmer
Séquençage à haut débit HiSeq HiSeq X Five, HiSeq 2500 upgrade, HiSeq 4000, Novaseq 6000 Illumina
Séquençage à haut débit Minion et Promethion Minion et Promethion Oxford Nanopore
Séquençage à haut débit Tape Station Tape station 4200 et bioanalyzer 2100 Agilent
Séquençage à petit débit / CQ MiSeq Illumina
Station de clusterisation cBot v2 Illumina

Prestations & formations

Offres de formations

Ouvert à la formation.

Écosystème

Département(s) de recherche

  • SDV (Sciences de la vie)

Liens PIA

  • LabEx GenMed

Labellisations

  • France Génomique

Écoles doctorales

Life Sciences and Health

Actualités