• Innovation Sociale - Sociétale - Solidaire
  • Qualité de vie - Santé - Aliments

CNRGH / Plateforme de génotypage

Plateforme technologique

Description

Au sein de l'Institut de Biologie François Jacob du CEA, le CNRGH (Centre National de Recherche en Génomique Humaine) a pour vocation de répondre aux questions scientifiques posées par la recherche en génétique et en génomique des maladies humaines et possède une expertise reconnue en génotypage et séquençage à haut-débit, grâce au développement et à la mise en oeuvre de technologies innovantes et intégrées. A ce titre, le CNRGH opère une plate-forme de génotypage à très haut-débit basée sur la technologie de puces à ADN Illumina®, et fait partie des 3 leaders européens dans le domaine. Entièrement robotisée, cette plateforme permet de réaliser rapidement des études pan-génomiques sur de grands nombres d'échantillons, grâce à l'utilisation de puces à très haute densité analysant entre 200000 et 5 millions de marqueurs simultanément. Une traçabilité optimale est assurée grâce à un suivi de l'ensemble des échantillons par un système de codes-barres et grâce au pilotage de la plate-forme par l'intermédiaire d'un LIMS (Laboratory Information Management System) traçant l'ensemble des étapes du processus de génotypage. Le débit actuel est de 1200 échantillons d'ADN par semaine, correspondant à la production de plus de 2.000.000.000 de génotypes en moyenne par semaine.

Contacts

  • Mme Céline BESSE

Thématiques d'innovation

Laboratoire de rattachement

Plan et accès

2, rue Gaston Crémieux
CEA Paris-Saclay, site d'Evry, CNRGH
91057 ÉVRY

Equipements et technologies

Technologies utilisées

génotypage sur puces de haute à très haute densité

Mots clés

Equipements spécifiques

Nom Modèle Marque
3 robots scanners iScan + Illumina
6 robots de pipetage Evo Tecan
Irradiateurs Infinium OmniExpress Illumina
Lame haute densité EPIC EPIC (méthylation) Illumina
Lame haute densité GSA GSA Illumina
Lame haute densité Infinium Human Infinium Human Core Exome Illumina
Lame haute densité Infinium Omni2,5 Infinium Omni2.5 Illumina
Lame haute densité Infinium Omni5,0 Infinium Omni5.0 Illumina
Lame haute densité iSelect iSelect Illumina

Prestations & formations

Offres de formations

Ouvert à la formation.

Écosystème

Département(s) de recherche

  • SDV (Sciences de la vie)

Liens PIA

  • LabEx GenMed

Écoles doctorales

Life Sciences and Health