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Qualité de vie - Santé - Aliments
@BRIDGe
Plateforme technologique
L'offre de services et d'équipements de la plateforme @BRIDGe (animal Biological Resources for Integrated and Digital Genomics), intègre la conservation de l'échantillon biologique et son analyse au niveau moléculaire, cellulaire ou tissulaire. Les domaines d'activité sont la génomique structurale et fonctionnelle, la microgénomique (analyse génomique à l'échelle cellulaire) spatiale ou en microfluidique, l'analyse morphologique. Les équipements, à la pointe de la technologie, sont aussi mis à disposition de ses utilisateurs qui bénéficieront d’un accompagnement par un personnel qualifié. Le Centre de Ressources Biologiques permet une gestion sécurisée des échantillons, leur caractérisation et leur distribution, ainsi que la fourniture de procédures expérimentales et d'outils pour l'analyse des données. Dans le cadre d’un Laboratoire Partenarial Associé (LPA) entre l’unité INRAE UMR1313 GABI (à laquelle est rattachées la plateforme) et la société Excilone, les partenaires ont associé leurs compétences complémentaires dans le domaine de la nanogénomique. Le but est de rechercher de nouvelles solutions diagnostiques dans le domaine de la santé animale et humaine via par exemple l’analyse des miRs contenues dans les exosomes et/vésicules extracellulaires (VEs) d’origines différentes ou dans le tissus fixée (FFPE). La plateforme @BRIDGe est certifiée ISO 9001:2015 et NFS 96 900 pour sa partie biobanque. La biobanque est labellisée ISC (Infrastructure Scientifique Collective) par l'INRAE depuis 2018 et fait partie de l’infrastructure nationale RARe (https://agrobrc-rare.org).
Thématiques d'innovation
Laboratoire de rattachement
Domaine de Vilvert
GABI, INRAE, centre de Jouy-en-Josas
78350 JOUY-EN-JOSAS
Technologies utilisées
Biobanque :- stockage d'échantillons
- extraction et contrôle qualité d'acides nucléiques
- banques BAC
- amplification génome entier (WGA)
Genomique :
- séquençage (16S, amplicons, petits génomes entiers)
- capture de séquence
- microarray Agilent
- qPCR, TaqMan Array Cards et OpenArray-ddPCR
- microdissection laser/microgenomique
Histologie :
- fixation des tissus, coupes et colorations
- immunomarquages automatisés sur coupes paraffine et congelées
- numérisation de lames histologiques en fond clair et fluorescence
Mots clés
- biobanque
- acides nucléiques
- BAC
- séquençage
- capture de séquence
- microarray Agilent
- PCR quantitative
- qPCR
- TLDA
- TAC
- OpenArray
- haut débit
- microdissection laser
- microgénomique
- lames virtuelles
- immunohistochimie
- hybridation in situ
- ddPCR
- Digital PCR
Equipements spécifiques
| Nom | Modèle | Marque |
|---|---|---|
| 2 Microdissecteurs laser (UV + IR) | Arcturus XT/ | Thermo Fisher |
| Automate d'immunohistochimie et Hybridation in situ | Bond RXm/ | Leica |
| Electrophorèse capillaire détection par fluorescence Electrophorèse capillaire à puces type Lab-On-Chip | Fragment Analyzer, Bioanalyzer 2100/ | Advanced Analytical, Agilent Genomics |
| PCR digitale (ddPCR) | QX200 ddPCR/ | BioRad |
| qPCR plaques 96/Tac Array Card/OpenArray | QuantStudio 12k Flex/ | Thermo Fisher |
| Robots d'extraction d'acides nucléiques (2) | ChemagicSTAR, Qiacube/ | Hamilton, Qiagen |
| Scan magnétique | Pannoramic SCAN 150/ | 3DHISTECH |
| Scanner Microarray | SystemArray/ | Agilent |
| Séquenceur MiSeq | MiSeq/ | Illumina |
| Station d'enrobage EG1160 | EG1160/ | Leica Biosystems |
Lien vers les équipements
Offres de formations
Département(s) de recherche
- SDV (Sciences de la vie)
Certifications
- ISO 9001:2015
Labellisations
- IBISA
Réseaux
- GENOPS (Réseau des plateformes de GENOmique Paris-Saclay)