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Qualité de vie - Santé - Aliments
@BRIDGe
Plateforme technologique
Plateforme @BRIDGe : Expertise en Génomique, Histologie et Biobanque
La plateforme @BRIDGe (animal Biological Resources for Integrated and Digital Genomics) propose une offre complète alliant conservation et analyse des échantillons biologiques aux niveaux moléculaire, cellulaire et tissulaire. Elle s'adresse aux chercheurs en biologie animale et offre des solutions technologiques avancées et un accompagnement personnalisé.
Nos Domaines d'Expertise
• Génomique structurale et fonctionnelle : séquençage, PCR quantitative et digitale, et analyse transcriptomique.
• Microgénomique et tri cellulaire : analyse à l'échelle cellulaire via tri cellulaire par microdissection laser ou par cytométrie en flux et extraction de nano-quantités de matériel (ADN, ARN, protéines, miR). Analyse cellule unique en microfluidique.
• Histologie et imagerie avancée : préparation, coloration et analyse morphologique des tissus.
• Biobanque et gestion des échantillons : stockage, caractérisation et distribution sécurisés.
Technologies et Services
• Une infrastructure de pointe : la plateforme met à disposition des équipements de haute technologie pour l'analyse génomique et tissulaire.
• Un accompagnement sur mesure : des experts accompagnent les utilisateurs dans la conception et la réalisation de leurs expériences.
• Formation le personnel de la plateforme forme ses utilisateurs à l’utilisation de ses équipements mis à disposition et à diverses techniques d’histologie et de biologie moléculaire (qPCR, ddPCR, microdissection laser, contrôle qualité des ARN, cytométrie).
• Un Centre de Ressources Biologiques (CRB) qui propose une gestion sécurisée des échantillons, leur caractérisation et leur distribution, ainsi que la fourniture de procédures expérimentales et d'outils pour l'analyse des données.
Certification et Réseaux Scientifiques
• Certification : ISO 9001:2015.
• Infrastructures : Infrastructure Scientifique Collective (ISC) par INRAE et membre de l’infrastructure nationale RARe (https://agrobrc-rare.org).
• Copilote et animateurs de plusieurs réseaux régionaux et nationaux
Partenariats stratégiques : collaboration avec la société Excilone dans le cadre du Laboratoire Partenarial Associé (LPA) pour le développement de solutions innovantes en nanogénomique. Le but est de rechercher de nouvelles solutions diagnostiques dans le domaine de la santé animale et humaine via par exemple l’analyse des miRs contenues dans les exosomes et vésicules extracellulaires (VEs) d’origines différentes ou dans les tissus fixés (FFPE).
La plateforme @BRIDGe est un acteur clé pour la recherche en biologie animale, offrant un environnement technologique et scientifique de premier plan. Contactez-nous pour en savoir plus sur nos services et collaborations !
Thématiques d'innovation
Laboratoire de rattachement
Domaine de Vilvert,
Bâtiment 320
GABI, INRAE, centre de Jouy-en-Josas
GABI, INRAE, centre de Jouy-en-Josas
78350 Jouy-en-Josas
Technologies utilisées
Biobanque :- stockage d'échantillons
- extraction et contrôle qualité d'acides nucléiques
- banques BAC
- amplification génome entier (WGA)
Génomique :
- séquençage (16S, amplicons, petits génomes entiers)
- capture de séquence
- qPCR, TaqMan Array Cards et OpenArray-ddPCR
- microdissection laser/microgenomique
Cyrtométrie :
- caractérisation et comptage des cellules eucaryotes/procaryotes ou de noyaux.
- Préparation de cellules en suspension avant tri cellulaire.
Tri cellulaire :
- par microdissection laser par cytométrie en cartouches étanches.
- Analyse cellule unique (single cell) avec différentes technologies (10XGenomics, Illumina, …).
Histologie :
- fixation des tissus, coupes et colorations
- immunomarquages automatisés sur coupes paraffine et congelées
- numérisation de lames histologiques en fond clair et fluorescence
Mots clés
- biobanque
- biobanking
- CRB
- animal
- acides nucléiques
- BAC
- séquençage
- 16S
- ONT
- Nanopore
- capture de séquences
- PCR quantitative
- qPCR
- TLDA
- TAC
- OpenArray
- ddPCR
- Digital PCR
- microdissection laser
- tri cellulaire
- microgénomique
- nanogénomique
- exosomes
- EVs
- single cell
- cellule unique
- génomique
- histologie
- lames virtuelles
- immunohistochimie
- hybridation in situ
- cytométrie
- ARN
- ADN
- service
Equipements spécifiques
| Nom | Modèle | Marque |
|---|---|---|
| 2 Microdissecteurs laser (UV + IR) | Arcturus XT | Thermo Fisher |
| Automate d'immunohistochimie et Hybridation in situ | Bond RXm | Leica |
| Electrophorèse capillaire détection par fluorescence Electrophorèse capillaire à puces type Lab-On-Chip | Fragment Analyzer, Bioanalyzer 2100 | Advanced Analytical, Agilent Genomics |
| PCR digitale (ddPCR) | QX200 ddPCR | BioRad |
| qPCR plaques 96/Tac Array Card/OpenArray | QuantStudio 12k Flex | Thermo Fisher |
| Robots d'extraction d'acides nucléiques (2) | ChemagicSTAR, Qiacube | Hamilton, Qiagen |
| Scan magnétique | Pannoramic SCAN 150 | 3DHISTECH |
| Scanner Microarray | SystemArray | Agilent |
| Séquenceur MiSeq | MiSeq | Illumina |
| Station d'enrobage EG1160 | EG1160 | Leica Biosystems |
Lien vers les équipements
Types de prestations
- Collaboration de R&D
- Conseil
- Prestations de service
- Formation
Offres de prestations
Prise en charge de projets (conception et réalisation)
Test de faisabilité pour tous nouveaux protocoles ou nouvelles technologie en collaboration avec le demandeur
Offres de formations
Etablissements de rattachement
Département(s) de recherche
- SDV (Sciences de la vie)
Certifications
- ISO 9001:2015
Labellisations
- IBISA
Réseaux
- GENOPS (Réseau des plateformes de GENOmique Paris-Saclay)