UMS AMMICA / Plateforme de Génomique

La plateforme de Génomique fondamentale et translationnelle a pour mission la réalisation de techniques d'analyse moléculaire (génomique, transcriptomique ?). Elle est constituée de deux modules. Le premier, dirigé par Nathalie Droin (CR INSERM), est spécialisé dans les techniques à haut débit répondant principalement aux besoins de programmes de recherche académiques et industriels. Le module définit avec les utilisateurs le design expérimental et l'optimisation du projet, accompagne pour la préparation des échantillons et les contrôles qualité, met à disposition différents appareils (Nanodrop, Bioanalyseur, appareils de PCR-Q, Covaris S220), produit des microarrays Affymetrix (Gene Expression, Oncoscan et Cytoscan) et réalise le séquençage haut débit des échantillons (technologies Séquenceur Ion Torrent, NovaSeq6000, MiSeq, MiniSeq Illumina). La PF développe actuellement le Single Cell (CNV, scRNA-seq, gene expression par RT-qPCR) et le WGS (standard et après traitement bisulfite) pour l'étude de la méthylation. Le deuxième module, connu sous le nom de laboratoire BMO, dirigé par Ludovic Lacroix (praticien Gustave Roussy), est davantage orienté vers la recherche translationnelle et préclinique, notamment en support des programmes de médecine de précision et des essais cliniques impliquant Gustave Roussy. Le laboratoire maîtrise des techniques de CGH, PCR et NGS ainsi que d'expression génique et il développe la PCR digitale. Il utilise des échantillons tissulaires, préparés et qualifiés par la plateforme PETRA, et a développé les techniques nécessaires à l'étude de l'ADN tumoral circulant. Le laboratoire BMO est engagé dans une démarche qualité et est certifié ISO9001 depuis 2008 (dernier renouvellement en 2017).

• Mme Nathalie DROIN
• M. Ludovic LACROIX