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IJPB / Observatoire du végétal - Plateforme de Cytologie et Imagerie Végétale

Plateforme technologique

Description

La plateforme OV-Cytologie/Imagerie de l’IJPB regroupe un ensemble unique d'expertise et d'instruments dédiés à la cytologie et à la microscopie des cellules et des tissus végétaux.

La plateforme OV-Cytologie/Imagerie est installée dans un bâtiment de 1000 m2 (B14) et regroupe 8 permanents. Elle héberge toutes les activités d'imagerie et de cytologie ainsi que les équipements nécessaires aux recherches menées par les équipes de l'IJPB, leurs partenaires et les utilisateurs externes. Récemment, elle a accueilli deux microscopes à super-résolution : un 3D STORM-2 photon-FLIM, unique en France, ainsi qu'un Leica Stellaris 8 STED-FLIM.

La plateforme OV-Cytologie/Imagerie est composée de cinq ateliers :
> Cytogénétique
> Hybridation in situ
> Immunocytochimie
> Microscopie
> Microdissection laser
Chaque atelier est sous la responsabilité d'un personnel permanent spécialisé, qui organise le service, accueille et forme les utilisateurs internes et externes, priorise et anticipe les développements technologiques. L’ensemble des techniques est développé sur un grand nombre d’espèces végétales dont A. thaliana, Brachypodium, la caméline, la tomate et le maïs.

La plateforme OV-Cytologie/Imagerie est leader en France en microscopie et cytologie végétale. Elle a été pionnière dans le développement de nouvelles techniques d'étude des plantes, notamment dans l'étude des cellules vivantes (imagerie du méristème vivant, interaction entre protéines par technique d'anisotropie de fluorescence chez les plantes par exemple). A l’heure actuelle, elle développe entre autres des stratégies d’imagerie basée sur le temps de demi vie de fluorescence et des techniques visant à microdisséquer différents types de tissus afin de réaliser des analyses transcriptomiques spatiales. Elle compte actuellement plus de 100 utilisateurs réguliers et est membre de l'Infrastructure Nationale de Recherche France-BioImaging (https://france-bioimaging.org/about/).

Contacts

  • M. Bertrand DUBREUCQ
  • VERNHETTES Samantha
  • VAYSSIERES Alice

Thématiques d'innovation

Laboratoire de rattachement

Plan et accès

Route de Saint-Cyr
Institut Jean-Pierre Bourgin - Sciences du Végétal (IJPB), Centre INRAE IDF - Versailles-Saclay
78026 VERSAILLES

Equipements et technologies

Technologies utilisées

imagerie (fond clair, fluorescence, confocale), cytologie, microdissection laser, immunohistologie, hybridation in situ, imagerie du végétal, imagerie du vivant

Mots clés

Equipements spécifiques

Nom Modèle Marque
Macroscopes Axiozoom fluo, Axiozoom fond clair ZEISS
Micoscope Electronique à balayage de paillasse Hirox
Microdissecteur laser PALM PALM ZEISS
Microscope confocal 710 710 ZEISS
Microscopes confocaux SP5, SP8, SP2 LEICA
Microtomes automatiques à rétraction (X3) LEICA, MICROM
Scanner de lames 160 lames (microscope robotisé fluo/fond clair, 160 lames) ZEISS/metasystems
Spectrophotomètre (190 - 1300 nm) ZEISS
Vibratomes (x2), CryoMicrotome LEICA, MICROM, THERMO

Prestations & formations

Offres de prestations

La plateforme est organisée en 5 ateliers : Cytogénétique, Hybridation in situ, Immunolocalisation, microscopie et microdissection laser. Chaque atelier dispose d'un responsable technique qui organise les prestations à effectuer, les accueils de chercheurs extérieurs, hiérarchise et fait remonter les besoins éventuels.
Au travers de ces activités, la plateforme de Cyotologie et d'Imagerie végétale couvre un ensemble de techniques, de la coupe à l'image : la cytologie classique, l'hybridation in situ, l'immunolocalisation, la cytogénétique et la microscopie, en fond clair, en fluorescence ou confocale.

Offres de formations

Au sein de la plateforme les mises aux points techniques, la maintenance, la gestion, la formation et l'encadrement des utilisateurs sont assurées par le personnel permanent, ainsi que la formation continue, au travers la mise en place de formation spécifiques et d'animation autour de l'imagerie et de la cytologie.

La plateforme est intégrée dans des formations au niveau national (master et formation de biologie cellulaire de l'école doctorale « Science du Végétal » pour UPSaclay et « ABIES » pour AgroParisTech) avec des travaux pratiques sur les microscopes confocaux et sur les stations d'analyse d'images. Environ 400 étudiants et stagiaires utilisent ces installations chaque année pour des visites ou des travaux pratiques en cytologie et imagerie.

Écosystème

Département(s) de recherche

  • SDV (Sciences de la vie)

Liens PIA

  • LabEx Sciences des Plantes de Saclay (SPS)

Labellisations

  • IBISA

Écoles doctorales

Biosphera

Actualités