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Qualité de vie - Santé - Aliments
IJPB / Observatoire du végétal - Phenoscope
Plateforme technologique
Le Phenoscope est un outil de phénotypage haut-débit dédié à la culture et à l'observation de centaines de plantes, cultivées dans des pots individuels. Il est typiquement exploité pour le suivi de la croissance végétative d'un grand nombre de génotypes sous différents régimes d'arrosage.
Les pots tournent en continu (cycle typique de 4 heures) le long d'un circuit fermé consistant en une succession d'allers-retours, ce qui permet d'exposer plus de 700 plantes à des conditions très homogènes. Des stations de pesée/arrosage sont utilisées pour suivre et ajuster la disponibilité en eau et en éléments nutritifs selon des scénarios précis définis par l'utilisateur pour chaque pot et chaque cycle. Des paramètres phénotypiques sont acquis au niveau des stations d'imagerie (visible et infra-rouge) de façon automatisée et non-destructive. Le Phenoscope est particulièrement étudié pour gérer des plantes de petite taille (Arabidopsis) au long de leur phase végétative (mais le Phenoscope XL -en développement- permettra bientôt de poursuivre au delà de l'initiation florale). Nous avons montré que le gain moyen permis par l'utilisation des Phenoscopes était d'un facteur 3 environ (en terme de réduction de l'hétérogénéité environnementale ou du nombre de répétitions nécessaires).
Les Phenoscopes sont idéalement exploités dans des projets de génétique quantitative (QTL, GWAS), des screens de mutants, ou toute autre expérience à grande échelle nécessitant la comparaison de centaines d'individus dans différents environnements. Ils peuvent aussi être utiles pour une caractérisation détaillée d'un petit nombre de génotypes (en particulier en comparaison avec d'autres jeux de données disponibles dans notre base de données) et pour l'établissement de courbes de réponse au traitement, où plusieurs niveaux graduels de stress sont appliqués.
Il n'existe que 3 de ces robots dans la communauté, tous situés à l'IJPB (INRAE site de Versailles) au sein de l'Observatoire du Végétal.
Thématiques d'innovation
Laboratoire de rattachement
Route de Saint-Cyr
Institut Jean-Pierre Bourgin, INRAE centre de Versailles-Grignon
78026 VERSAILLES
Technologies utilisées
phénotypage haut-débitMots clés
- phénotypage haut-débit
- homogénéité et reproductibilité
- conditions contrôlées
- Arabidopsis
- génétique quantitative
- crible génétique
- stress hydrique
- stress azoté
Equipements spécifiques
| Nom | Modèle | Marque |
|---|---|---|
| 1 'Phenoscope XL' | pour plantes de moyennes dimensions ou Arabidopsis au stade reproducteur/ | INRAE - IJPB - Phenoscope |
| 2 Robots de phénotypage à haut-débit 'Phenoscope' | pour plantes de petite taille au stade végétatif/ | INRAE - IJPB - Phenoscope |
Offres de formations
Département(s) de recherche
- SDV (Sciences de la vie)
Liens PIA
- LabEx Sciences des Plantes de Saclay (SPS)
Labellisations
- IBISA