• Qualité de vie - Santé - Aliments

Laboratoire Européen de Recherche pour la Polyarthrite rhumatoïde (GENHOTEL)

Unité de recherche EA 3886

Description

L'objectif du laboratoire GenHotel est de préciser le déterminisme multifactoriel de la polyarthrite rhumatoïde. Dans ce contexte, notre activité vise à caractériser des variants génomiques de séquences, de nombre de copies et d'expression dans des échantillons familiaux. L'interaction entre les différents facteurs de risque est également investiguée.

Nous développons également une approche de biologie computationnelle des systèmes, avec la construction d'un réseau d'interactions maladie-spécifique en utilisant des données de petite échelle, des données multi-omiques et l'inférence automatique d'un model booléen afin de réaliser des études dynamiques et des simulations in silico du système.

Le but final est d'ouvrir de nouvelles pistes vers un traitement définitif, voire une prévention de la polyarthrite rhumatoïde, et d'étendre cette recherche à d'autres maladies multifactorielles d'importance majeure pour la santé publique par le biais de collaborations nationales et internationales.

Contacts

  • Mme Élisabeth PETIT-TEIXEIRA

Thématiques d'innovation

Plan et accès

2, rue Gaston Crémieux
Genopole d'Evry
91057 ÉVRY

Nos domaines de recherche

Expertises

-simulations in silico
-polyarthrite rhumatoïde
-maladies multifactorielles
-génétique et génomique humaine
-biologie computationnelle des systèmes
-modélisation logique (modèles booléens)

Secteurs d'applications

  • Biotechnologies
  • Santé / Bien-être

Effectif total

Effectif total : 8
Nombre de chercheurs : 6
Nombre de doctorants : 3

Equipements ouverts à la collaboration

PCR digitale à droplets

Mots clés

Nos résultats

Offre de valorisation

Savoir-faire : PCR digitale, statistiques en génétique, construction de réseaux maladie-spécifiques (SBGN), modélisation logique de réseaux cellulaires

Exemple(s) de travaux

-modélisation logique à grande échelle
-base de connaissance interactive de la PR
-détermination d'un profil d'expression spécifique d'un stade de pre-PR
-caractérisation de variants rares spécifiques de la PR par analyse WES et WGS
-pipeline automatique pour l'inférence de modèles booléens à partir de cartes moléculaires

Publications

Relations industrielles et scientifiques

Collaborations scientifiques

- France : CNRGH, IFJ-CEA, Evry, CHSF Corbeil, CHU Clermont-Ferrand, LaMME, UMR8071 CNRS, Université d'Evry,
INRIA Lifeware team, ENS Paris, Institut Curie, EISBM Lyon, Université de Lille
- Europe : Luxembourg Center of Systems Biomedicine
- International : HU de Geneve (Suisse)
University of Nebraska-Lincoln (USA), Weill Cornel Medical College, NY, USA, MRC Cancer Unit ? University of Cambridge
Disease maps consortium, CoLoMoTo (Consortium for logical models and tools)

Écosystème

Etablissements de rattachement

Université Evry Val d'Essonne

Département(s) de recherche

  • SDV (Sciences de la vie)