IJPB / Observatoire du végétal - Plateforme de Biochimie

La plateforme regroupe les équipements essentiels requis pour la biochimie des protéines (expression, extraction, purification et caractérisation) et propose des méthodes d'analyse biochimique, biophysique et structurale des protéines et de leurs assemblages. L’OV-Biochimie dispose d’équipement innovants pour le contrôle qualité, par nanoDSF (Tycho-NanoTemper technologies GmbH), des protéines purifiées, ainsi que pour l’étude des interactions biomoléculaires in vitro par des approches de MicroScaleThermophoresis (Monolith NT 115-NanoTemper technologies GmbH) et aussi en utilisant la nanoDSF. L’OV-Biochimie de l’IJPB soutient le développement de projets de biochimie liés à la caractérisation fonctionnelle et structurale des protéines végétales. Ses activités incluent la production de protéines recombinantes, l’étude des modifications post-traductionnelles et l’analyse des interactions protéines-ligands in vitro. Elle offre également des outils de pointe pour la caractérisation des réseaux d’interaction protéiques in planta.

L’équipe de l'OV-Biochimie comprend deux responsables et des référents techniques et logistiques. Elle propose des services de réalisation d’expériences ou de conseils techniques pour :
> Expression recombinante de protéines végétales : Production de protéines dans des hôtes homologues et hétérologues (E. coli, cellules d’insectes).
> Étude des interactions protéine-ligand : Tests des interactions protéine-protéine et protéine-ligand en solution, détermination des paramètres thermodynamiques par Thermophorèse (MST), Differential scanning fluorométrie (DSF), nanoDSF, fluorescence intrinsèque du tryptophane ou enzymologie.
> Identification des partenaires protéiques in planta : Identification des partenaires protéiques par biotinylation de proximité, TAP, ou co-immunoprécipitation, via expression in planta ou en lignée cellulaire d'Arabidopsis.
> Préparation d’échantillons pour la protéomique : Service spécialisé en préparation d’échantillons pour analyses protéomiques, incluant extraction, dosage, purification, séparation et digestion enzymatique des protéines, pour garantir des résultats robustes en spectrométrie de masse).

Les études menées par l'OV-Biochimie s'intègrent dans de nombreux projets de recherche, contribuant au développement de pratiques agricoles durables et respectueuses de l’environnement, en lien avec les principes de l’agroécologie. À cet effet, l'OV-Biochimie est partenaire de l’Objet Interdisciplinaire (OI) Métabiodivex de l’Université Paris-Saclay et émarge dans plusieurs projets contribuant aux développements de approches agroécologiques : méthode de lutte contre les plantes parasites, identification de composés allélopathiques.

• MIREAU Hakim
• DE SAINT GERMAIN Alexandre