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Energie, Ecologie, Environnement
ESE / UNICELL
Plateforme technologique
UNICELL est une plateforme de recherche et développement créée par l'équipe DEEM et installée dans une salle blanche (ISO5/ISO7) destinée à l’analyse de génomes et de transcriptomes de cellules individuelles à partir de communautés microbiennes complexes.
Ses objectifs sont le développement et la mise en place de protocoles pour l’amplification génomique et la production de transcriptomes à partir des cellules isolées de procaryotes (bactéries, archées) et d’eucaryotes unicellulaires (protistes).
D'autres applications single-cell pour des microorganismes sont envisageables.
Thématiques d'innovation
Gif sur Yvette
91190 Gif sur Yvette
Technologies utilisées
Analyse et tri des cellules par cytomètrie en flux (autofluorescence et fluorescence induite)Lyse cellulaire et amplification génomique par la technique WGA (Whole Genome Amplification)
Amplification gènes cible par PCR (16S, 18S)
Séquençage ADN genomique par Nanopore (amplicons et lectures longues)
Mots clés
- Génomique en cellule unique
- cytomètrie en flux
- communautés microbiennes complexes
- procaryotes
- eucaryotes unicellulaires (protistes)
Equipements spécifiques
| Nom | Modèle | Marque |
|---|---|---|
| Cytomètre en flux trieur | FACSAria™ III | BD |
| Système robotique de pipetage | Freedom EVO 150 | TECAN |
| Appareil de qPCR | Automate Light Cycler™ 480 II | Roche |
| Microscope à épifluorescence | DM2000 LED | Leica |
| Hotte PCR | Captair Bio 321 Smart | Erlab |
| Système de stérilisation UV-C | Bio-Link BLX 254 | Bio-Link |
| Système de microfluidique | ONYX, Atrandi Biosciences | Atrandi Bioscience |
| Compteur de Cellules microbiennes | Quantom Tx | Logos Biosystem |
| Microscope inversé | Dlll3000 B | Leica |
| Micromanipulateur | PatchMan NP2 | Eppendorf |
Types de prestations
- Prestations de service
Offres de prestations
Etablissements de rattachement
Département(s) de recherche
- SDV (Sciences de la vie)