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Informatique, BioInformatique, Systèmes Complexes (IBISC)

Unité de recherche EA 4526

Description

Les recherches conduites au sein d'IBISC traitent de la modélisation, la conception, la simulation et la validation des systèmes complexes, qu'ils soient vivants ou artificiels. Le laboratoire est organisé en 4 équipes (AROBAS, COSMO, IRA2, SIMOB) permettant de définir 2 axes de recherche transverses : STIC & Vivant (biologie computationnelle, bio-informatique, assistance à la personne, signal et image pour le biomédical) et STIC & Smart System (systèmes autonomes et intelligents, systèmes ouverts et sûrs). IBISC possède non seulement des plateformes référencées et soutenues par Genopole : EVR@ (Environnements Virtuels et de Réalité Augmentée, http://evra.ibisc.univ-evry.fr/ ) et la plateforme logicielle de bioinformatique EvryRNA (https://evryrna.ibisc.univ-evry.fr/) mais aussi des plateformes diverses en lien avec les systèmes intelligents : véhicules 2 roues, drones, robots. (Le laboratoire est aussi présent sur un site rue du Pelvoux à Evry).

Contacts

  • M. Samia BOUCHAFA-BRUNEAU

Thématiques d'innovation

Plan et accès

23, boulevard de France
91034 EVRY

Nos domaines de recherche

Expertises

- algorithmique et recherche opérationnelle
- méthodes formelles, systèmes multiagents
- bioinformatique des ARNs
- apprentissage statistique, classification
- interaction Homme/Machine
- réalité augmentée et réalité virtuelle
- robotique ambiante
- modélisation des systèmes complexes
- traitement du signal et des images
- perception et contrôle des systèmes autonomes

Secteurs d'applications

  • Informatique
  • Biotechnologies
  • Industrie aéronautique & spatiale
  • Industrie automobile / Mobilité
  • Transport / Logistique
  • Agroalimentaire
  • Particuliers / Services à la personne

Effectif total

Effectif total : 125
Nombre de chercheurs : 55
Nombre de doctorants : 55

Equipements ouverts à la collaboration

Académique et Industrielle :
- la plateforme EvryRNA (http://evryrna.ibisc.univ-evry.fr) est une plateforme logicielle dédiée aux ARNs. Elle met à disposition de la communauté scientifique plusieurs bases de données (une dizaine à l'heure actuelle), pour la plupart sous forme de serveurs web, permettant de prédire la structure d'ARN, de rechercher différentes classes d'ARNs non-codants tels que les microARNs et les piARNs à partir ou dans des séquences génomiques. Tous ces logiciels correspondent à des algorithmes originaux publiés dans des journaux internationaux, et sont largement utilisés par la communauté internationale. Le logiciel le plus utilisé est miRNAFold, qui est l'outil le plus rapide (et le plus efficace) de la littérature pour la recherche des microARNs (et plus précisément les structures en épingles à cheveux des précurseurs de microARNs).
- la plateforme ISThMe (Illustration de Stratégies de prescription Médicale)
- la plate-forme EVR@ (Environnements Virtuels et de Réalité Augmentée) comportant 5 groupements de matériels :
1- EVR@-IM : plateforme immersive, dotée de 4 plans de projection à stréréoscopie active 2,5mX2mX2m, d'un système de tracking temps réel de de la tête et de la main de l'utilisateur et de deux systèmes à retour d'effort 3d de type PHANTOM OMNI.
2- EVR@-HS : plateforme semi-immersive dotée d'un écran 3,2mX2,4m et d'un système de projection avec stéréoscopie active et d'un système de tracking temps réel de la tête et des mains de l'utilisateur.
3- EVR@-TR : plateformes de RV transportables, comportant une table tactile multitouch avec stéréoscopie active, un système de tracking temps réel de la tête et de la main et un système à retour d'effort 3d de type PHANTOM OMNI ainsi qu'un poste supportant un casque de RV de type OCULUS ainsi qu'une Kinect et une LeapMotion.
4- EVR@-WE : des équipements de Réalité Augmentée comportant un casque de RV de type nVisor-ST, des capteurs de type caméras, GPS, accéléromètres.
5- EVR@-RO des éléments robotiques pilotables par Internet, dont deux bras robotiques de type FANUC LRMate 200i, deux robots humanoïdes de type NAO, deux robots mobiles.
- volière dédiée aux drones (zone de robotique mobile sécurisée).
- véhicules à deux roues motorisés instrumentés dédiés à la sécurité passive (alerte conducteur) et sécurité active (automatisation de la conduite)

Mots clés

Nos résultats

Offre de valorisation

Brevets :
- Méthodes et appareil de configurations de signaux. F. d'Alché-Buc , D. Zwierski, J.-P. Nadal.
- Système de contrôle de la phase de décharge des cycles de charge-décharge d'une batterie rechargeable, et d'un dispositif hôte muni d'une batterie intelligente. J.-N. Patillon, F. d'Alché-Buc, J.-P. Nadal.
- Method of drilling a ground using a robobtic arm (Laredj Benchikh, Daniel Perpezat, Lotfi Beji, Sara Cascarino : France, Patent n° : WO 2016005701 A2, 2016 - System and Method for the Synchronous Reproduction of Movements of Hand or End Member by a Robot. Laredj Benchikh, France, Patent n° : WO 2011/039429 A1. 2011.
- Method for Training a Robot or the Like, and Device for Implementing Said Method. Laredj Benchikh, France, Patent n° : WO 2009/090542 A2. 2009.
- Optimisation du processus d'assemblage des interrupteurs de haute tension. Wu, F. Chu (Peng) et al, n° CN102930073 A, Chine, 2013.

Logiciels :
- bioinformatique : logiciel OKVAR-Boost et plateforme EvryRNA regroupant plusieurs logiciels de bioinformatique développés au sein du laboratoire pour la prédiction et l'analyse des ARNs (Tfold, P-DCFold, SSCA, miRNAFold, miRBoost, ncRNAclassifier, piRPred, IpiRId, BioKop, miRBoost-Plant)
- machine learning : OPERA-lib
- réalité augmentée : ARCS (Framework RA http://arcs.ibisc.univ-evry.fr )
- autres : nsgp R package

Exemple(s) de travaux

- Edrone (Europe : 2017-2020) : Educational for Drones (Drone architecture, piloting techniques, drones equipment for measurement and monitoring activities, processing of measurement data, drones maintenance, Laws for the privacy, risk analysis and prevention,...)
- CESAAR-AVC(CIFRE 2017-2020 ) : Conception et Evaluation d'un Système d'Assistance à l'Auto-Rééducation du membre supérieur en Réalité Virtuelle après AVC.
- VIROLO++ ( ANR 2016-2019) : Étude de la prise de virage en moto : applications à la formation et aux STI.
- Quasicool (ANR JCJC 2013-2017) : Refroidissement des quasicristaux : des pavages aléatoires aux pavages périodiques.
- NewTun ( FUI 2012-2017) : Nouvelles méthodes de construction de tunnels ( contrôle interactif des mouvements de sol, dimensionnement du pré-soutènement, Robotisation du pré-soutènement, Instrumentation).
- SIRAM (CIFRE 2012-2016) : Vers un Système Interactif de Réalité Augmentée Mobile pour la supervision de scénarios de maintenance industrielle.
- Algorithme et Logiciel rapide pour la recherche de microARNs potentiels dans ds séquences génomiques (logiciel disponible sur la platefome EvryRNA et utilisé par la communauté scientifique internationale).

Publications

Relations industrielles et scientifiques

Collaborations scientifiques

- France : Institut français des sciences et technologies des transports, de l'aménagement et des réseaux (IFSTTAR), Institut des plantes de Paris-Saclay Saclay, Institut Curie, LIMSI, ENS-SATIE, LIP6, L2S, LISV - ISSB (Institut de Biologie Synthétique et des Systèmes (Evry)), CHSF et groupe Visiome, IRBA
- International : plusieurs partenariats Hubert Curien (Orchid avec Taïwan, Polonium avec la Pologne), BFHZ avec Univ. Regensburg, Cathedra Francesa avec escola de Medicina de Sao Paolo (Brésil), Centre de Developpement des Technologies Avancées (CDTA d'Alger, Algérie), Tongji University, Fuzhou University, Xi'an Jiaotong University, University of Sicene and Technology of China, Northwestern Polytechnic University, Nanging Agricutural University, MLR MIT Cambridge, Automated Vehicles, VSS Lab, Mexico, Université de Constantine 1 et de Constantine 2 (Algérie), Institut Suisse de Bioinformatique (SIB)

Projets européens :
- ecoDriver (2011-2015)
- eFuture (2010-2013) - Edrone Educational for Drone (2016-2019)
Projet FUI : NewTun (2012-2017) Projets ANR :
- VIROLO++ (2016-2019)
- Quasicool (2013-2017)
- SVeDaS (JCJC 2017-2020)
- OATA (JCJC 2016-2019)
- COOPERCOM (2011-2014)
- ABV (2009-2013)
- ORIGAMI (2010-2013)

Collaborations privées

- collaboration avec de nombreuses entreprises

Écosystème

Etablissements de rattachement

Université Evry Val d'Essonne

Groupements institutionnels

  • Institut pour la Transition Energétique - SuperGrid
  • Institut pour la Transition Energétique - Efficacity

Département(s) de recherche

  • MEP (Mécanique, Energétique et procédés)
  • SDV (Sciences de la vie)
  • STIC (Sciences et technologie de l'information et de la communication)

Pôles de compétitivités

  • Cap Digital
  • Systematic Paris Region
  • Mov'eo
  • ASTECH